Protein–RNA interactions for Protein: P33146

Cdh15, Cadherin-15, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh15P33146 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cdh15P33146 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cdh15P33146 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cdh15P33146 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cdh15P33146 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cdh15P33146 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cdh15P33146 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cdh15P33146 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cdh15P33146 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cdh15P33146 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdh15P33146 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdh15P33146 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdh15P33146 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdh15P33146 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdh15P33146 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdh15P33146 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdh15P33146 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdh15P33146 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdh15P33146 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdh15P33146 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdh15P33146 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdh15P33146 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdh15P33146 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdh15P33146 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdh15P33146 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdh15P33146 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdh15P33146 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdh15P33146 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdh15P33146 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdh15P33146 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdh15P33146 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdh15P33146 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdh15P33146 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdh15P33146 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdh15P33146 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdh15P33146 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdh15P33146 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdh15P33146 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdh15P33146 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdh15P33146 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdh15P33146 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdh15P33146 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdh15P33146 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdh15P33146 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdh15P33146 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdh15P33146 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdh15P33146 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdh15P33146 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdh15P33146 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdh15P33146 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdh15P33146 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdh15P33146 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdh15P33146 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdh15P33146 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdh15P33146 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdh15P33146 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdh15P33146 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdh15P33146 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdh15P33146 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdh15P33146 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdh15P33146 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdh15P33146 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdh15P33146 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdh15P33146 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdh15P33146 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdh15P33146 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdh15P33146 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdh15P33146 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdh15P33146 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdh15P33146 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdh15P33146 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdh15P33146 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdh15P33146 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdh15P33146 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdh15P33146 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdh15P33146 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdh15P33146 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdh15P33146 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdh15P33146 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdh15P33146 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdh15P33146 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdh15P33146 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdh15P33146 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdh15P33146 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdh15P33146 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdh15P33146 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdh15P33146 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdh15P33146 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdh15P33146 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdh15P33146 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdh15P33146 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdh15P33146 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdh15P33146 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdh15P33146 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdh15P33146 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdh15P33146 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdh15P33146 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdh15P33146 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdh15P33146 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdh15P33146 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms