Protein–RNA interactions for Protein: P28663

Napb, Beta-soluble NSF attachment protein, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NapbP28663 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NapbP28663 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NapbP28663 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NapbP28663 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NapbP28663 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NapbP28663 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NapbP28663 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NapbP28663 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NapbP28663 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NapbP28663 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NapbP28663 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NapbP28663 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NapbP28663 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NapbP28663 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NapbP28663 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NapbP28663 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NapbP28663 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NapbP28663 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NapbP28663 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NapbP28663 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NapbP28663 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NapbP28663 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NapbP28663 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NapbP28663 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NapbP28663 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NapbP28663 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NapbP28663 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NapbP28663 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NapbP28663 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NapbP28663 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NapbP28663 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NapbP28663 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NapbP28663 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NapbP28663 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NapbP28663 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NapbP28663 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NapbP28663 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NapbP28663 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NapbP28663 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NapbP28663 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NapbP28663 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NapbP28663 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NapbP28663 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NapbP28663 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NapbP28663 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NapbP28663 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NapbP28663 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NapbP28663 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NapbP28663 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NapbP28663 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NapbP28663 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NapbP28663 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NapbP28663 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NapbP28663 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NapbP28663 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NapbP28663 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NapbP28663 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NapbP28663 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NapbP28663 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NapbP28663 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NapbP28663 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NapbP28663 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NapbP28663 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NapbP28663 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NapbP28663 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NapbP28663 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NapbP28663 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NapbP28663 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NapbP28663 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NapbP28663 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NapbP28663 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NapbP28663 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NapbP28663 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NapbP28663 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NapbP28663 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NapbP28663 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NapbP28663 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NapbP28663 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NapbP28663 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NapbP28663 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NapbP28663 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NapbP28663 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NapbP28663 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NapbP28663 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NapbP28663 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NapbP28663 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NapbP28663 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NapbP28663 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NapbP28663 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NapbP28663 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NapbP28663 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NapbP28663 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NapbP28663 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NapbP28663 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NapbP28663 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NapbP28663 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NapbP28663 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NapbP28663 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NapbP28663 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NapbP28663 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms