Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxd10P28359 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxd10P28359 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxd10P28359 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Hoxd10P28359 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxd10P28359 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxd10P28359 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxd10P28359 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxd10P28359 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxd10P28359 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Hoxd10P28359 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxd10P28359 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxd10P28359 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxd10P28359 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Hoxd10P28359 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxd10P28359 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxd10P28359 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxd10P28359 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxd10P28359 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxd10P28359 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxd10P28359 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxd10P28359 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxd10P28359 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxd10P28359 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxd10P28359 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxd10P28359 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxd10P28359 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxd10P28359 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxd10P28359 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxd10P28359 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxd10P28359 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxd10P28359 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxd10P28359 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxd10P28359 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxd10P28359 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxd10P28359 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxd10P28359 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxd10P28359 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxd10P28359 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxd10P28359 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxd10P28359 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
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Hoxd10P28359 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxd10P28359 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxd10P28359 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxd10P28359 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxd10P28359 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxd10P28359 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxd10P28359 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxd10P28359 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxd10P28359 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxd10P28359 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxd10P28359 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hoxd10P28359 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hoxd10P28359 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
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Hoxd10P28359 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hoxd10P28359 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Hoxd10P28359 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Hoxd10P28359 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hoxd10P28359 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hoxd10P28359 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Hoxd10P28359 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hoxd10P28359 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hoxd10P28359 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Hoxd10P28359 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hoxd10P28359 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hoxd10P28359 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hoxd10P28359 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hoxd10P28359 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hoxd10P28359 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hoxd10P28359 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hoxd10P28359 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hoxd10P28359 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hoxd10P28359 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hoxd10P28359 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hoxd10P28359 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hoxd10P28359 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hoxd10P28359 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hoxd10P28359 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hoxd10P28359 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hoxd10P28359 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hoxd10P28359 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxd10P28359 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxd10P28359 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms