Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PparaP23204 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PparaP23204 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PparaP23204 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PparaP23204 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PparaP23204 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PparaP23204 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PparaP23204 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PparaP23204 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PparaP23204 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PparaP23204 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PparaP23204 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PparaP23204 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PparaP23204 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PparaP23204 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PparaP23204 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PparaP23204 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PparaP23204 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PparaP23204 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PparaP23204 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PparaP23204 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PparaP23204 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PparaP23204 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PparaP23204 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PparaP23204 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PparaP23204 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PparaP23204 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PparaP23204 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PparaP23204 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PparaP23204 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PparaP23204 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PparaP23204 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PparaP23204 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PparaP23204 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PparaP23204 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PparaP23204 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PparaP23204 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PparaP23204 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PparaP23204 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PparaP23204 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PparaP23204 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PparaP23204 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PparaP23204 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PparaP23204 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PparaP23204 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PparaP23204 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PparaP23204 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PparaP23204 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PparaP23204 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PparaP23204 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PparaP23204 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PparaP23204 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PparaP23204 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PparaP23204 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PparaP23204 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PparaP23204 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PparaP23204 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PparaP23204 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PparaP23204 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PparaP23204 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PparaP23204 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PparaP23204 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PparaP23204 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PparaP23204 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PparaP23204 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PparaP23204 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PparaP23204 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PparaP23204 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PparaP23204 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PparaP23204 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PparaP23204 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PparaP23204 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PparaP23204 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PparaP23204 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PparaP23204 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PparaP23204 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PparaP23204 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PparaP23204 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PparaP23204 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PparaP23204 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PparaP23204 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PparaP23204 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PparaP23204 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PparaP23204 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PparaP23204 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PparaP23204 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PparaP23204 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PparaP23204 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PparaP23204 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PparaP23204 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PparaP23204 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PparaP23204 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PparaP23204 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PparaP23204 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PparaP23204 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PparaP23204 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PparaP23204 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PparaP23204 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PparaP23204 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PparaP23204 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms