Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P18530 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P18530 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P18530 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
P18530 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P18530 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P18530 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P18530 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P18530 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P18530 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
P18530 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P18530 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P18530 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P18530 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P18530 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P18530 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P18530 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
P18530 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P18530 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P18530 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P18530 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P18530 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P18530 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P18530 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P18530 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P18530 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P18530 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P18530 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P18530 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P18530 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
P18530 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P18530 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P18530 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P18530 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P18530 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P18530 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P18530 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P18530 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
P18530 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P18530 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
P18530 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P18530 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P18530 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P18530 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P18530 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P18530 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P18530 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P18530 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P18530 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P18530 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P18530 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P18530 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P18530 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P18530 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P18530 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P18530 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P18530 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P18530 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P18530 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P18530 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P18530 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P18530 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
P18530 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
P18530 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
P18530 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
P18530 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
P18530 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
P18530 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
P18530 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
P18530 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
P18530 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
P18530 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P18530 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P18530 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P18530 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P18530 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
P18530 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P18530 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P18530 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
P18530 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P18530 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P18530 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P18530 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P18530 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
P18530 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P18530 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
P18530 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P18530 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P18530 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P18530 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P18530 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P18530 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P18530 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P18530 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P18530 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P18530 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P18530 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P18530 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P18530 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P18530 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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