Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sptan1P16546 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sptan1P16546 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sptan1P16546 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sptan1P16546 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sptan1P16546 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sptan1P16546 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sptan1P16546 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sptan1P16546 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sptan1P16546 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sptan1P16546 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sptan1P16546 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sptan1P16546 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sptan1P16546 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sptan1P16546 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sptan1P16546 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sptan1P16546 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sptan1P16546 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sptan1P16546 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sptan1P16546 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sptan1P16546 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sptan1P16546 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sptan1P16546 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sptan1P16546 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sptan1P16546 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sptan1P16546 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sptan1P16546 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Sptan1P16546 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sptan1P16546 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sptan1P16546 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sptan1P16546 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sptan1P16546 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sptan1P16546 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sptan1P16546 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sptan1P16546 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Sptan1P16546 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sptan1P16546 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Sptan1P16546 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sptan1P16546 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sptan1P16546 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sptan1P16546 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sptan1P16546 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sptan1P16546 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sptan1P16546 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sptan1P16546 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sptan1P16546 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sptan1P16546 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sptan1P16546 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Sptan1P16546 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sptan1P16546 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sptan1P16546 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sptan1P16546 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sptan1P16546 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sptan1P16546 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sptan1P16546 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sptan1P16546 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Sptan1P16546 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sptan1P16546 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sptan1P16546 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Sptan1P16546 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sptan1P16546 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sptan1P16546 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sptan1P16546 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sptan1P16546 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sptan1P16546 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sptan1P16546 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sptan1P16546 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sptan1P16546 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sptan1P16546 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sptan1P16546 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sptan1P16546 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sptan1P16546 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sptan1P16546 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sptan1P16546 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sptan1P16546 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sptan1P16546 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sptan1P16546 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sptan1P16546 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sptan1P16546 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sptan1P16546 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sptan1P16546 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sptan1P16546 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sptan1P16546 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sptan1P16546 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sptan1P16546 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Sptan1P16546 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sptan1P16546 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sptan1P16546 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sptan1P16546 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sptan1P16546 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sptan1P16546 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sptan1P16546 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sptan1P16546 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sptan1P16546 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sptan1P16546 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sptan1P16546 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Sptan1P16546 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sptan1P16546 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sptan1P16546 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sptan1P16546 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms