Protein–RNA interactions for Protein: P12246

Apcs, Serum amyloid P-component, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApcsP12246 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ApcsP12246 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ApcsP12246 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ApcsP12246 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ApcsP12246 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ApcsP12246 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ApcsP12246 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ApcsP12246 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ApcsP12246 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ApcsP12246 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ApcsP12246 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ApcsP12246 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ApcsP12246 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ApcsP12246 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ApcsP12246 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ApcsP12246 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ApcsP12246 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ApcsP12246 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ApcsP12246 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ApcsP12246 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ApcsP12246 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ApcsP12246 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ApcsP12246 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ApcsP12246 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ApcsP12246 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ApcsP12246 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ApcsP12246 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ApcsP12246 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ApcsP12246 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ApcsP12246 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ApcsP12246 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ApcsP12246 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ApcsP12246 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ApcsP12246 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ApcsP12246 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ApcsP12246 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ApcsP12246 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ApcsP12246 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ApcsP12246 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ApcsP12246 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ApcsP12246 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ApcsP12246 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ApcsP12246 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ApcsP12246 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
ApcsP12246 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ApcsP12246 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ApcsP12246 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ApcsP12246 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ApcsP12246 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ApcsP12246 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ApcsP12246 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ApcsP12246 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ApcsP12246 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ApcsP12246 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ApcsP12246 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ApcsP12246 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ApcsP12246 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ApcsP12246 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ApcsP12246 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ApcsP12246 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ApcsP12246 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ApcsP12246 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ApcsP12246 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ApcsP12246 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ApcsP12246 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ApcsP12246 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ApcsP12246 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ApcsP12246 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ApcsP12246 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ApcsP12246 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ApcsP12246 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ApcsP12246 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ApcsP12246 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ApcsP12246 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ApcsP12246 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ApcsP12246 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ApcsP12246 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ApcsP12246 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ApcsP12246 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ApcsP12246 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ApcsP12246 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ApcsP12246 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ApcsP12246 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ApcsP12246 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ApcsP12246 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ApcsP12246 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ApcsP12246 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ApcsP12246 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ApcsP12246 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ApcsP12246 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ApcsP12246 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ApcsP12246 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ApcsP12246 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ApcsP12246 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ApcsP12246 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ApcsP12246 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ApcsP12246 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ApcsP12246 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ApcsP12246 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ApcsP12246 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms