Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxd4P10628 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxd4P10628 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxd4P10628 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxd4P10628 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxd4P10628 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxd4P10628 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxd4P10628 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxd4P10628 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxd4P10628 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxd4P10628 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxd4P10628 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxd4P10628 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxd4P10628 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxd4P10628 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxd4P10628 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxd4P10628 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxd4P10628 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxd4P10628 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxd4P10628 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxd4P10628 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxd4P10628 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxd4P10628 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxd4P10628 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxd4P10628 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxd4P10628 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxd4P10628 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxd4P10628 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxd4P10628 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxd4P10628 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxd4P10628 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxd4P10628 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxd4P10628 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxd4P10628 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxd4P10628 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxd4P10628 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxd4P10628 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxd4P10628 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxd4P10628 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxd4P10628 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxd4P10628 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxd4P10628 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxd4P10628 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxd4P10628 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxd4P10628 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxd4P10628 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxd4P10628 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxd4P10628 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxd4P10628 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxd4P10628 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxd4P10628 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxd4P10628 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxd4P10628 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxd4P10628 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxd4P10628 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxd4P10628 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxd4P10628 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxd4P10628 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxd4P10628 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxd4P10628 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxd4P10628 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxd4P10628 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxd4P10628 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxd4P10628 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxd4P10628 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxd4P10628 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxd4P10628 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxd4P10628 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxd4P10628 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxd4P10628 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxd4P10628 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxd4P10628 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxd4P10628 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxd4P10628 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxd4P10628 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxd4P10628 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxd4P10628 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxd4P10628 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hoxd4P10628 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hoxd4P10628 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hoxd4P10628 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hoxd4P10628 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hoxd4P10628 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hoxd4P10628 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hoxd4P10628 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hoxd4P10628 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxd4P10628 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxd4P10628 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxd4P10628 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxd4P10628 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxd4P10628 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxd4P10628 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxd4P10628 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxd4P10628 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxd4P10628 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxd4P10628 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxd4P10628 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxd4P10628 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxd4P10628 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxd4P10628 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms