Protein–RNA interactions for Protein: P07351

Ifna4, Interferon alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna4P07351 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifna4P07351 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifna4P07351 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifna4P07351 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifna4P07351 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifna4P07351 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifna4P07351 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifna4P07351 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifna4P07351 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifna4P07351 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifna4P07351 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifna4P07351 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifna4P07351 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifna4P07351 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifna4P07351 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifna4P07351 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifna4P07351 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifna4P07351 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifna4P07351 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifna4P07351 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifna4P07351 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifna4P07351 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifna4P07351 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifna4P07351 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifna4P07351 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifna4P07351 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifna4P07351 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifna4P07351 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifna4P07351 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifna4P07351 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifna4P07351 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifna4P07351 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifna4P07351 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifna4P07351 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifna4P07351 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifna4P07351 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifna4P07351 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifna4P07351 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifna4P07351 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifna4P07351 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifna4P07351 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifna4P07351 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifna4P07351 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifna4P07351 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifna4P07351 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifna4P07351 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifna4P07351 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifna4P07351 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifna4P07351 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifna4P07351 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifna4P07351 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifna4P07351 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifna4P07351 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifna4P07351 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Ifna4P07351 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ifna4P07351 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ifna4P07351 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ifna4P07351 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ifna4P07351 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ifna4P07351 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ifna4P07351 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifna4P07351 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifna4P07351 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifna4P07351 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifna4P07351 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifna4P07351 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifna4P07351 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifna4P07351 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifna4P07351 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifna4P07351 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifna4P07351 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifna4P07351 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifna4P07351 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifna4P07351 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifna4P07351 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifna4P07351 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifna4P07351 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifna4P07351 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifna4P07351 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifna4P07351 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifna4P07351 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifna4P07351 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifna4P07351 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifna4P07351 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifna4P07351 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifna4P07351 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifna4P07351 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifna4P07351 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifna4P07351 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifna4P07351 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifna4P07351 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifna4P07351 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifna4P07351 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifna4P07351 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifna4P07351 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifna4P07351 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifna4P07351 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifna4P07351 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifna4P07351 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifna4P07351 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms