Protein–RNA interactions for Protein: P02830

Hoxa7, Homeobox protein Hox-A7, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa7P02830 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Hoxa7P02830 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hoxa7P02830 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hoxa7P02830 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hoxa7P02830 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hoxa7P02830 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hoxa7P02830 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hoxa7P02830 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hoxa7P02830 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hoxa7P02830 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hoxa7P02830 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hoxa7P02830 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hoxa7P02830 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hoxa7P02830 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hoxa7P02830 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hoxa7P02830 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hoxa7P02830 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hoxa7P02830 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hoxa7P02830 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hoxa7P02830 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hoxa7P02830 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hoxa7P02830 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hoxa7P02830 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hoxa7P02830 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hoxa7P02830 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hoxa7P02830 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hoxa7P02830 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hoxa7P02830 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hoxa7P02830 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hoxa7P02830 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hoxa7P02830 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hoxa7P02830 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hoxa7P02830 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hoxa7P02830 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hoxa7P02830 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hoxa7P02830 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hoxa7P02830 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hoxa7P02830 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hoxa7P02830 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hoxa7P02830 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Hoxa7P02830 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hoxa7P02830 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hoxa7P02830 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hoxa7P02830 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hoxa7P02830 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hoxa7P02830 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hoxa7P02830 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hoxa7P02830 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hoxa7P02830 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hoxa7P02830 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hoxa7P02830 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hoxa7P02830 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hoxa7P02830 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hoxa7P02830 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hoxa7P02830 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hoxa7P02830 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hoxa7P02830 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hoxa7P02830 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hoxa7P02830 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hoxa7P02830 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hoxa7P02830 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Hoxa7P02830 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hoxa7P02830 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hoxa7P02830 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Hoxa7P02830 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Hoxa7P02830 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Hoxa7P02830 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hoxa7P02830 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hoxa7P02830 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hoxa7P02830 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hoxa7P02830 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hoxa7P02830 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hoxa7P02830 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hoxa7P02830 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hoxa7P02830 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hoxa7P02830 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hoxa7P02830 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hoxa7P02830 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hoxa7P02830 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hoxa7P02830 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hoxa7P02830 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hoxa7P02830 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hoxa7P02830 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hoxa7P02830 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hoxa7P02830 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Hoxa7P02830 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hoxa7P02830 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hoxa7P02830 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hoxa7P02830 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hoxa7P02830 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hoxa7P02830 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hoxa7P02830 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hoxa7P02830 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hoxa7P02830 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hoxa7P02830 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hoxa7P02830 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hoxa7P02830 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hoxa7P02830 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hoxa7P02830 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hoxa7P02830 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms