Protein–RNA interactions for Protein: O88425

Nme6, Nucleoside diphosphate kinase 6, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme6O88425 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nme6O88425 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nme6O88425 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nme6O88425 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Nme6O88425 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nme6O88425 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nme6O88425 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nme6O88425 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nme6O88425 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nme6O88425 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nme6O88425 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nme6O88425 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nme6O88425 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nme6O88425 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nme6O88425 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nme6O88425 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nme6O88425 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nme6O88425 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nme6O88425 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nme6O88425 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nme6O88425 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nme6O88425 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nme6O88425 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nme6O88425 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nme6O88425 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nme6O88425 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Nme6O88425 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nme6O88425 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nme6O88425 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nme6O88425 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nme6O88425 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nme6O88425 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nme6O88425 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nme6O88425 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nme6O88425 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nme6O88425 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nme6O88425 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nme6O88425 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nme6O88425 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nme6O88425 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nme6O88425 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nme6O88425 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nme6O88425 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nme6O88425 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nme6O88425 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nme6O88425 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Nme6O88425 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nme6O88425 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nme6O88425 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Nme6O88425 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nme6O88425 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Nme6O88425 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nme6O88425 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nme6O88425 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nme6O88425 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nme6O88425 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nme6O88425 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nme6O88425 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nme6O88425 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nme6O88425 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nme6O88425 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nme6O88425 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nme6O88425 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nme6O88425 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nme6O88425 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Nme6O88425 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nme6O88425 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nme6O88425 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nme6O88425 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nme6O88425 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nme6O88425 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nme6O88425 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nme6O88425 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nme6O88425 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nme6O88425 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nme6O88425 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nme6O88425 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nme6O88425 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nme6O88425 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nme6O88425 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Nme6O88425 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nme6O88425 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nme6O88425 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nme6O88425 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nme6O88425 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nme6O88425 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nme6O88425 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nme6O88425 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nme6O88425 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nme6O88425 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nme6O88425 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nme6O88425 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nme6O88425 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nme6O88425 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nme6O88425 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nme6O88425 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nme6O88425 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Nme6O88425 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nme6O88425 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nme6O88425 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms