Protein–RNA interactions for Protein: O70138

Mmp8, Neutrophil collagenase, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp8O70138 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mmp8O70138 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mmp8O70138 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mmp8O70138 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mmp8O70138 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mmp8O70138 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mmp8O70138 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mmp8O70138 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mmp8O70138 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Mmp8O70138 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mmp8O70138 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mmp8O70138 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mmp8O70138 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mmp8O70138 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Mmp8O70138 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mmp8O70138 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mmp8O70138 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mmp8O70138 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mmp8O70138 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mmp8O70138 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Mmp8O70138 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mmp8O70138 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mmp8O70138 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mmp8O70138 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Mmp8O70138 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mmp8O70138 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mmp8O70138 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mmp8O70138 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mmp8O70138 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mmp8O70138 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mmp8O70138 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Mmp8O70138 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mmp8O70138 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mmp8O70138 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mmp8O70138 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mmp8O70138 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mmp8O70138 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mmp8O70138 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mmp8O70138 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mmp8O70138 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mmp8O70138 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mmp8O70138 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mmp8O70138 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mmp8O70138 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Mmp8O70138 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mmp8O70138 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mmp8O70138 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mmp8O70138 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mmp8O70138 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mmp8O70138 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mmp8O70138 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mmp8O70138 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mmp8O70138 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mmp8O70138 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mmp8O70138 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mmp8O70138 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mmp8O70138 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mmp8O70138 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mmp8O70138 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mmp8O70138 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mmp8O70138 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mmp8O70138 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Mmp8O70138 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Mmp8O70138 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Mmp8O70138 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Mmp8O70138 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Mmp8O70138 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Mmp8O70138 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Mmp8O70138 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Mmp8O70138 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Mmp8O70138 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mmp8O70138 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mmp8O70138 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mmp8O70138 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Mmp8O70138 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mmp8O70138 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mmp8O70138 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mmp8O70138 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mmp8O70138 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mmp8O70138 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mmp8O70138 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mmp8O70138 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mmp8O70138 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mmp8O70138 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mmp8O70138 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mmp8O70138 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mmp8O70138 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mmp8O70138 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mmp8O70138 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mmp8O70138 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mmp8O70138 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mmp8O70138 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mmp8O70138 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mmp8O70138 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mmp8O70138 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mmp8O70138 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mmp8O70138 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Mmp8O70138 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mmp8O70138 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mmp8O70138 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms