Protein–RNA interactions for Protein: O54851

Gjd2, Gap junction delta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjd2O54851 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gjd2O54851 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gjd2O54851 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gjd2O54851 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gjd2O54851 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gjd2O54851 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gjd2O54851 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gjd2O54851 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gjd2O54851 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gjd2O54851 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gjd2O54851 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gjd2O54851 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gjd2O54851 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gjd2O54851 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gjd2O54851 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gjd2O54851 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gjd2O54851 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gjd2O54851 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gjd2O54851 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gjd2O54851 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gjd2O54851 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Gjd2O54851 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gjd2O54851 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gjd2O54851 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gjd2O54851 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gjd2O54851 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gjd2O54851 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gjd2O54851 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gjd2O54851 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gjd2O54851 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gjd2O54851 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gjd2O54851 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gjd2O54851 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gjd2O54851 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gjd2O54851 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gjd2O54851 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gjd2O54851 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gjd2O54851 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gjd2O54851 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gjd2O54851 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gjd2O54851 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gjd2O54851 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gjd2O54851 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gjd2O54851 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gjd2O54851 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gjd2O54851 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gjd2O54851 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gjd2O54851 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gjd2O54851 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gjd2O54851 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gjd2O54851 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gjd2O54851 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gjd2O54851 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gjd2O54851 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gjd2O54851 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Gjd2O54851 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gjd2O54851 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gjd2O54851 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gjd2O54851 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gjd2O54851 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gjd2O54851 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gjd2O54851 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gjd2O54851 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gjd2O54851 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gjd2O54851 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Gjd2O54851 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gjd2O54851 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gjd2O54851 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gjd2O54851 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Gjd2O54851 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gjd2O54851 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gjd2O54851 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gjd2O54851 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gjd2O54851 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gjd2O54851 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gjd2O54851 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gjd2O54851 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gjd2O54851 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gjd2O54851 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gjd2O54851 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gjd2O54851 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gjd2O54851 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gjd2O54851 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gjd2O54851 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Gjd2O54851 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gjd2O54851 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gjd2O54851 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gjd2O54851 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gjd2O54851 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Gjd2O54851 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gjd2O54851 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Gjd2O54851 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gjd2O54851 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gjd2O54851 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gjd2O54851 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gjd2O54851 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gjd2O54851 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gjd2O54851 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gjd2O54851 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gjd2O54851 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms