Protein–RNA interactions for Protein: O43248

HOXC11, Homeobox protein Hox-C11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC11O43248 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXC11O43248 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXC11O43248 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXC11O43248 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXC11O43248 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXC11O43248 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXC11O43248 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXC11O43248 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXC11O43248 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXC11O43248 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXC11O43248 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXC11O43248 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXC11O43248 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXC11O43248 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXC11O43248 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXC11O43248 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXC11O43248 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXC11O43248 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXC11O43248 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXC11O43248 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXC11O43248 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXC11O43248 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXC11O43248 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXC11O43248 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXC11O43248 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXC11O43248 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXC11O43248 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXC11O43248 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXC11O43248 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXC11O43248 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXC11O43248 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXC11O43248 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXC11O43248 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXC11O43248 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXC11O43248 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXC11O43248 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXC11O43248 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXC11O43248 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXC11O43248 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXC11O43248 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXC11O43248 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXC11O43248 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXC11O43248 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXC11O43248 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXC11O43248 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXC11O43248 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXC11O43248 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXC11O43248 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXC11O43248 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXC11O43248 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXC11O43248 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXC11O43248 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXC11O43248 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXC11O43248 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXC11O43248 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXC11O43248 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXC11O43248 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXC11O43248 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXC11O43248 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXC11O43248 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXC11O43248 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HOXC11O43248 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HOXC11O43248 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HOXC11O43248 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HOXC11O43248 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXC11O43248 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXC11O43248 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXC11O43248 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXC11O43248 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXC11O43248 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXC11O43248 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXC11O43248 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXC11O43248 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXC11O43248 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXC11O43248 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXC11O43248 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXC11O43248 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXC11O43248 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXC11O43248 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXC11O43248 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXC11O43248 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXC11O43248 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXC11O43248 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXC11O43248 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXC11O43248 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXC11O43248 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXC11O43248 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXC11O43248 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXC11O43248 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXC11O43248 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXC11O43248 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXC11O43248 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXC11O43248 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXC11O43248 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXC11O43248 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXC11O43248 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXC11O43248 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXC11O43248 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXC11O43248 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXC11O43248 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms