Protein–RNA interactions for Protein: O35927

Ctnnd2, Catenin delta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd2O35927 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ctnnd2O35927 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ctnnd2O35927 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ctnnd2O35927 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ctnnd2O35927 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ctnnd2O35927 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ctnnd2O35927 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ctnnd2O35927 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Ctnnd2O35927 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ctnnd2O35927 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ctnnd2O35927 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ctnnd2O35927 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ctnnd2O35927 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ctnnd2O35927 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Ctnnd2O35927 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ctnnd2O35927 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ctnnd2O35927 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ctnnd2O35927 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ctnnd2O35927 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ctnnd2O35927 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ctnnd2O35927 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ctnnd2O35927 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ctnnd2O35927 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ctnnd2O35927 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ctnnd2O35927 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ctnnd2O35927 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ctnnd2O35927 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ctnnd2O35927 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ctnnd2O35927 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ctnnd2O35927 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ctnnd2O35927 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ctnnd2O35927 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ctnnd2O35927 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ctnnd2O35927 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ctnnd2O35927 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ctnnd2O35927 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Ctnnd2O35927 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ctnnd2O35927 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ctnnd2O35927 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ctnnd2O35927 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ctnnd2O35927 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ctnnd2O35927 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ctnnd2O35927 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ctnnd2O35927 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ctnnd2O35927 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ctnnd2O35927 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ctnnd2O35927 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ctnnd2O35927 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ctnnd2O35927 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ctnnd2O35927 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ctnnd2O35927 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ctnnd2O35927 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ctnnd2O35927 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ctnnd2O35927 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ctnnd2O35927 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ctnnd2O35927 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Ctnnd2O35927 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ctnnd2O35927 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ctnnd2O35927 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ctnnd2O35927 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ctnnd2O35927 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ctnnd2O35927 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ctnnd2O35927 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ctnnd2O35927 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ctnnd2O35927 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ctnnd2O35927 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ctnnd2O35927 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ctnnd2O35927 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ctnnd2O35927 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ctnnd2O35927 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ctnnd2O35927 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ctnnd2O35927 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ctnnd2O35927 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ctnnd2O35927 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ctnnd2O35927 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Ctnnd2O35927 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ctnnd2O35927 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ctnnd2O35927 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ctnnd2O35927 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ctnnd2O35927 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ctnnd2O35927 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ctnnd2O35927 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ctnnd2O35927 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ctnnd2O35927 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ctnnd2O35927 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ctnnd2O35927 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ctnnd2O35927 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ctnnd2O35927 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ctnnd2O35927 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Ctnnd2O35927 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Ctnnd2O35927 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ctnnd2O35927 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ctnnd2O35927 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ctnnd2O35927 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ctnnd2O35927 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ctnnd2O35927 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ctnnd2O35927 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ctnnd2O35927 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ctnnd2O35927 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ctnnd2O35927 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms