Protein–RNA interactions for Protein: O35887

Calu, Calumenin, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CaluO35887 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CaluO35887 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CaluO35887 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CaluO35887 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CaluO35887 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CaluO35887 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CaluO35887 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CaluO35887 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CaluO35887 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CaluO35887 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CaluO35887 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CaluO35887 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CaluO35887 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CaluO35887 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CaluO35887 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CaluO35887 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CaluO35887 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CaluO35887 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CaluO35887 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CaluO35887 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CaluO35887 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CaluO35887 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CaluO35887 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CaluO35887 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CaluO35887 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CaluO35887 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CaluO35887 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CaluO35887 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CaluO35887 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CaluO35887 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CaluO35887 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CaluO35887 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CaluO35887 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CaluO35887 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CaluO35887 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CaluO35887 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CaluO35887 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CaluO35887 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CaluO35887 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CaluO35887 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CaluO35887 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CaluO35887 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CaluO35887 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CaluO35887 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CaluO35887 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CaluO35887 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CaluO35887 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CaluO35887 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CaluO35887 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CaluO35887 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CaluO35887 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CaluO35887 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CaluO35887 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CaluO35887 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CaluO35887 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CaluO35887 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CaluO35887 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CaluO35887 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CaluO35887 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CaluO35887 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CaluO35887 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CaluO35887 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CaluO35887 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CaluO35887 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CaluO35887 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CaluO35887 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CaluO35887 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CaluO35887 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CaluO35887 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CaluO35887 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CaluO35887 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CaluO35887 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CaluO35887 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CaluO35887 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CaluO35887 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CaluO35887 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CaluO35887 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CaluO35887 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CaluO35887 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CaluO35887 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CaluO35887 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CaluO35887 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CaluO35887 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CaluO35887 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CaluO35887 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CaluO35887 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CaluO35887 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CaluO35887 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CaluO35887 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CaluO35887 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CaluO35887 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CaluO35887 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CaluO35887 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CaluO35887 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CaluO35887 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CaluO35887 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CaluO35887 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CaluO35887 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CaluO35887 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CaluO35887 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms