Protein–RNA interactions for Protein: O35711

Ppfibp2, Liprin-beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp2O35711 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ppfibp2O35711 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ppfibp2O35711 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Ppfibp2O35711 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ppfibp2O35711 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ppfibp2O35711 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ppfibp2O35711 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ppfibp2O35711 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ppfibp2O35711 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ppfibp2O35711 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ppfibp2O35711 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ppfibp2O35711 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ppfibp2O35711 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Ppfibp2O35711 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ppfibp2O35711 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ppfibp2O35711 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ppfibp2O35711 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ppfibp2O35711 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ppfibp2O35711 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Ppfibp2O35711 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Ppfibp2O35711 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ppfibp2O35711 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ppfibp2O35711 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ppfibp2O35711 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ppfibp2O35711 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ppfibp2O35711 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ppfibp2O35711 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ppfibp2O35711 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Ppfibp2O35711 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Ppfibp2O35711 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ppfibp2O35711 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ppfibp2O35711 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ppfibp2O35711 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ppfibp2O35711 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ppfibp2O35711 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ppfibp2O35711 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ppfibp2O35711 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ppfibp2O35711 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ppfibp2O35711 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ppfibp2O35711 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ppfibp2O35711 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ppfibp2O35711 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ppfibp2O35711 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ppfibp2O35711 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ppfibp2O35711 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ppfibp2O35711 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ppfibp2O35711 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ppfibp2O35711 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Ppfibp2O35711 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ppfibp2O35711 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ppfibp2O35711 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ppfibp2O35711 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ppfibp2O35711 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ppfibp2O35711 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ppfibp2O35711 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ppfibp2O35711 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ppfibp2O35711 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ppfibp2O35711 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ppfibp2O35711 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ppfibp2O35711 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ppfibp2O35711 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ppfibp2O35711 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ppfibp2O35711 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ppfibp2O35711 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ppfibp2O35711 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ppfibp2O35711 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Ppfibp2O35711 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ppfibp2O35711 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ppfibp2O35711 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ppfibp2O35711 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ppfibp2O35711 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ppfibp2O35711 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ppfibp2O35711 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ppfibp2O35711 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ppfibp2O35711 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ppfibp2O35711 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ppfibp2O35711 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ppfibp2O35711 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ppfibp2O35711 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ppfibp2O35711 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ppfibp2O35711 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ppfibp2O35711 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ppfibp2O35711 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ppfibp2O35711 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ppfibp2O35711 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ppfibp2O35711 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ppfibp2O35711 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ppfibp2O35711 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ppfibp2O35711 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ppfibp2O35711 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ppfibp2O35711 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ppfibp2O35711 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ppfibp2O35711 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ppfibp2O35711 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Ppfibp2O35711 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ppfibp2O35711 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ppfibp2O35711 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ppfibp2O35711 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ppfibp2O35711 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ppfibp2O35711 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms