Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prrt1O35449 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prrt1O35449 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prrt1O35449 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prrt1O35449 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prrt1O35449 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prrt1O35449 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prrt1O35449 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prrt1O35449 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prrt1O35449 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prrt1O35449 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prrt1O35449 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prrt1O35449 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prrt1O35449 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prrt1O35449 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prrt1O35449 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prrt1O35449 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prrt1O35449 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prrt1O35449 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prrt1O35449 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prrt1O35449 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prrt1O35449 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrt1O35449 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrt1O35449 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrt1O35449 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrt1O35449 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrt1O35449 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrt1O35449 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrt1O35449 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrt1O35449 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrt1O35449 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrt1O35449 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrt1O35449 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrt1O35449 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrt1O35449 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrt1O35449 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrt1O35449 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrt1O35449 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrt1O35449 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrt1O35449 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrt1O35449 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrt1O35449 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrt1O35449 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrt1O35449 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrt1O35449 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrt1O35449 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrt1O35449 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrt1O35449 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrt1O35449 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrt1O35449 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrt1O35449 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrt1O35449 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrt1O35449 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrt1O35449 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrt1O35449 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrt1O35449 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrt1O35449 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrt1O35449 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrt1O35449 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrt1O35449 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrt1O35449 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrt1O35449 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrt1O35449 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrt1O35449 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Prrt1O35449 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Prrt1O35449 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrt1O35449 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrt1O35449 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrt1O35449 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrt1O35449 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrt1O35449 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrt1O35449 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrt1O35449 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrt1O35449 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrt1O35449 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrt1O35449 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrt1O35449 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrt1O35449 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrt1O35449 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrt1O35449 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrt1O35449 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrt1O35449 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrt1O35449 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrt1O35449 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrt1O35449 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrt1O35449 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrt1O35449 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrt1O35449 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrt1O35449 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrt1O35449 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrt1O35449 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrt1O35449 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrt1O35449 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrt1O35449 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrt1O35449 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrt1O35449 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrt1O35449 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrt1O35449 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrt1O35449 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrt1O35449 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms