Protein–RNA interactions for Protein: O35114

Scarb2, Lysosome membrane protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarb2O35114 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scarb2O35114 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scarb2O35114 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scarb2O35114 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scarb2O35114 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scarb2O35114 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Scarb2O35114 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scarb2O35114 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scarb2O35114 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scarb2O35114 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scarb2O35114 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Scarb2O35114 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Scarb2O35114 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Scarb2O35114 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Scarb2O35114 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Scarb2O35114 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Scarb2O35114 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Scarb2O35114 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Scarb2O35114 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Scarb2O35114 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Scarb2O35114 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Scarb2O35114 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Scarb2O35114 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Scarb2O35114 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Scarb2O35114 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Scarb2O35114 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scarb2O35114 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scarb2O35114 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scarb2O35114 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scarb2O35114 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scarb2O35114 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Scarb2O35114 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scarb2O35114 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scarb2O35114 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scarb2O35114 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scarb2O35114 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scarb2O35114 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scarb2O35114 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scarb2O35114 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scarb2O35114 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scarb2O35114 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scarb2O35114 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scarb2O35114 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scarb2O35114 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scarb2O35114 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scarb2O35114 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scarb2O35114 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scarb2O35114 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Scarb2O35114 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Scarb2O35114 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scarb2O35114 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scarb2O35114 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scarb2O35114 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scarb2O35114 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scarb2O35114 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scarb2O35114 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scarb2O35114 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scarb2O35114 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scarb2O35114 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scarb2O35114 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scarb2O35114 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Scarb2O35114 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scarb2O35114 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scarb2O35114 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scarb2O35114 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scarb2O35114 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scarb2O35114 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scarb2O35114 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scarb2O35114 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scarb2O35114 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Scarb2O35114 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scarb2O35114 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scarb2O35114 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Scarb2O35114 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scarb2O35114 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scarb2O35114 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Scarb2O35114 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Scarb2O35114 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scarb2O35114 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Scarb2O35114 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scarb2O35114 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scarb2O35114 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scarb2O35114 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scarb2O35114 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scarb2O35114 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scarb2O35114 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scarb2O35114 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scarb2O35114 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scarb2O35114 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scarb2O35114 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scarb2O35114 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scarb2O35114 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scarb2O35114 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scarb2O35114 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scarb2O35114 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scarb2O35114 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scarb2O35114 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scarb2O35114 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scarb2O35114 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scarb2O35114 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
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