Protein–RNA interactions for Protein: O15335

CHAD, Chondroadherin, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHADO15335 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHADO15335 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHADO15335 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CHADO15335 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHADO15335 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHADO15335 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHADO15335 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHADO15335 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHADO15335 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHADO15335 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHADO15335 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHADO15335 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHADO15335 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHADO15335 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CHADO15335 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHADO15335 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHADO15335 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHADO15335 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CHADO15335 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHADO15335 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHADO15335 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHADO15335 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHADO15335 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHADO15335 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHADO15335 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHADO15335 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHADO15335 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CHADO15335 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHADO15335 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHADO15335 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHADO15335 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHADO15335 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHADO15335 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHADO15335 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHADO15335 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHADO15335 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHADO15335 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHADO15335 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHADO15335 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHADO15335 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHADO15335 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHADO15335 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHADO15335 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHADO15335 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHADO15335 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHADO15335 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHADO15335 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHADO15335 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHADO15335 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHADO15335 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHADO15335 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHADO15335 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHADO15335 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHADO15335 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHADO15335 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHADO15335 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHADO15335 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHADO15335 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHADO15335 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHADO15335 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHADO15335 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHADO15335 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHADO15335 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHADO15335 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CHADO15335 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHADO15335 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHADO15335 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHADO15335 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHADO15335 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHADO15335 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHADO15335 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHADO15335 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHADO15335 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHADO15335 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHADO15335 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHADO15335 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHADO15335 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHADO15335 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHADO15335 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHADO15335 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHADO15335 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHADO15335 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHADO15335 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHADO15335 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHADO15335 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHADO15335 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHADO15335 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CHADO15335 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHADO15335 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHADO15335 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHADO15335 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHADO15335 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHADO15335 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHADO15335 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHADO15335 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHADO15335 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHADO15335 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHADO15335 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHADO15335 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHADO15335 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms