Protein–RNA interactions for Protein: O08574

Mesp2, Mesoderm posterior protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp2O08574 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mesp2O08574 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mesp2O08574 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mesp2O08574 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mesp2O08574 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mesp2O08574 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mesp2O08574 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mesp2O08574 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mesp2O08574 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mesp2O08574 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mesp2O08574 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mesp2O08574 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mesp2O08574 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mesp2O08574 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mesp2O08574 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mesp2O08574 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mesp2O08574 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mesp2O08574 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mesp2O08574 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mesp2O08574 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mesp2O08574 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mesp2O08574 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mesp2O08574 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mesp2O08574 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mesp2O08574 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mesp2O08574 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mesp2O08574 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mesp2O08574 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mesp2O08574 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mesp2O08574 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mesp2O08574 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mesp2O08574 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mesp2O08574 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mesp2O08574 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mesp2O08574 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Mesp2O08574 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mesp2O08574 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mesp2O08574 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mesp2O08574 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mesp2O08574 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mesp2O08574 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mesp2O08574 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mesp2O08574 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mesp2O08574 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mesp2O08574 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mesp2O08574 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mesp2O08574 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mesp2O08574 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Mesp2O08574 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mesp2O08574 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mesp2O08574 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mesp2O08574 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mesp2O08574 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mesp2O08574 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mesp2O08574 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mesp2O08574 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mesp2O08574 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mesp2O08574 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mesp2O08574 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mesp2O08574 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mesp2O08574 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mesp2O08574 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mesp2O08574 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mesp2O08574 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mesp2O08574 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Mesp2O08574 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mesp2O08574 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mesp2O08574 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mesp2O08574 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mesp2O08574 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mesp2O08574 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mesp2O08574 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mesp2O08574 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mesp2O08574 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mesp2O08574 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mesp2O08574 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mesp2O08574 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mesp2O08574 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Mesp2O08574 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mesp2O08574 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Mesp2O08574 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mesp2O08574 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mesp2O08574 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mesp2O08574 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mesp2O08574 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mesp2O08574 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Mesp2O08574 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mesp2O08574 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mesp2O08574 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mesp2O08574 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mesp2O08574 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Mesp2O08574 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Mesp2O08574 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mesp2O08574 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mesp2O08574 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mesp2O08574 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mesp2O08574 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mesp2O08574 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Mesp2O08574 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mesp2O08574 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms