Protein–RNA interactions for Protein: J3QPU5

Ccer2, Coiled-coil glutamate-rich protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer2J3QPU5 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccer2J3QPU5 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccer2J3QPU5 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccer2J3QPU5 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccer2J3QPU5 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccer2J3QPU5 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccer2J3QPU5 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccer2J3QPU5 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccer2J3QPU5 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccer2J3QPU5 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccer2J3QPU5 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccer2J3QPU5 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccer2J3QPU5 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccer2J3QPU5 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccer2J3QPU5 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccer2J3QPU5 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccer2J3QPU5 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccer2J3QPU5 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ccer2J3QPU5 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ccer2J3QPU5 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ccer2J3QPU5 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ccer2J3QPU5 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Ccer2J3QPU5 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ccer2J3QPU5 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccer2J3QPU5 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccer2J3QPU5 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccer2J3QPU5 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccer2J3QPU5 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccer2J3QPU5 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccer2J3QPU5 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccer2J3QPU5 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccer2J3QPU5 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccer2J3QPU5 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccer2J3QPU5 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ccer2J3QPU5 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Ccer2J3QPU5 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ccer2J3QPU5 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ccer2J3QPU5 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ccer2J3QPU5 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Ccer2J3QPU5 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ccer2J3QPU5 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccer2J3QPU5 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccer2J3QPU5 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccer2J3QPU5 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccer2J3QPU5 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccer2J3QPU5 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccer2J3QPU5 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccer2J3QPU5 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccer2J3QPU5 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccer2J3QPU5 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccer2J3QPU5 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccer2J3QPU5 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccer2J3QPU5 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccer2J3QPU5 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccer2J3QPU5 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccer2J3QPU5 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccer2J3QPU5 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccer2J3QPU5 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccer2J3QPU5 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccer2J3QPU5 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccer2J3QPU5 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccer2J3QPU5 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccer2J3QPU5 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccer2J3QPU5 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ccer2J3QPU5 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Ccer2J3QPU5 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ccer2J3QPU5 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ccer2J3QPU5 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ccer2J3QPU5 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ccer2J3QPU5 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ccer2J3QPU5 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ccer2J3QPU5 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ccer2J3QPU5 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ccer2J3QPU5 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Ccer2J3QPU5 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Ccer2J3QPU5 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ccer2J3QPU5 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ccer2J3QPU5 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ccer2J3QPU5 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ccer2J3QPU5 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ccer2J3QPU5 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ccer2J3QPU5 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ccer2J3QPU5 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccer2J3QPU5 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccer2J3QPU5 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccer2J3QPU5 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccer2J3QPU5 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccer2J3QPU5 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccer2J3QPU5 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccer2J3QPU5 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccer2J3QPU5 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccer2J3QPU5 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccer2J3QPU5 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccer2J3QPU5 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccer2J3QPU5 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccer2J3QPU5 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccer2J3QPU5 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccer2J3QPU5 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccer2J3QPU5 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccer2J3QPU5 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms