Protein–RNA interactions for Protein: J3QPE5

Gm5849, Predicted gene 5849, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5849J3QPE5 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5849J3QPE5 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5849J3QPE5 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5849J3QPE5 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5849J3QPE5 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5849J3QPE5 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5849J3QPE5 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5849J3QPE5 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5849J3QPE5 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5849J3QPE5 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5849J3QPE5 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5849J3QPE5 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5849J3QPE5 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5849J3QPE5 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5849J3QPE5 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5849J3QPE5 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm5849J3QPE5 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5849J3QPE5 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5849J3QPE5 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5849J3QPE5 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5849J3QPE5 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5849J3QPE5 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5849J3QPE5 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5849J3QPE5 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5849J3QPE5 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5849J3QPE5 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5849J3QPE5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5849J3QPE5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5849J3QPE5 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5849J3QPE5 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5849J3QPE5 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5849J3QPE5 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5849J3QPE5 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5849J3QPE5 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5849J3QPE5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5849J3QPE5 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5849J3QPE5 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5849J3QPE5 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5849J3QPE5 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5849J3QPE5 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5849J3QPE5 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5849J3QPE5 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5849J3QPE5 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5849J3QPE5 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5849J3QPE5 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5849J3QPE5 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5849J3QPE5 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5849J3QPE5 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5849J3QPE5 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5849J3QPE5 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5849J3QPE5 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5849J3QPE5 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5849J3QPE5 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5849J3QPE5 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5849J3QPE5 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5849J3QPE5 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5849J3QPE5 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5849J3QPE5 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5849J3QPE5 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5849J3QPE5 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5849J3QPE5 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5849J3QPE5 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5849J3QPE5 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5849J3QPE5 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5849J3QPE5 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5849J3QPE5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5849J3QPE5 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5849J3QPE5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5849J3QPE5 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5849J3QPE5 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5849J3QPE5 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5849J3QPE5 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5849J3QPE5 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5849J3QPE5 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5849J3QPE5 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5849J3QPE5 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5849J3QPE5 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5849J3QPE5 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5849J3QPE5 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5849J3QPE5 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5849J3QPE5 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5849J3QPE5 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5849J3QPE5 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5849J3QPE5 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5849J3QPE5 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5849J3QPE5 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5849J3QPE5 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5849J3QPE5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5849J3QPE5 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5849J3QPE5 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5849J3QPE5 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5849J3QPE5 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5849J3QPE5 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5849J3QPE5 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5849J3QPE5 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5849J3QPE5 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5849J3QPE5 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5849J3QPE5 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5849J3QPE5 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5849J3QPE5 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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