Protein–RNA interactions for Protein: G3X952

Zkscan2, MCG20985, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zkscan2G3X952 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zkscan2G3X952 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zkscan2G3X952 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zkscan2G3X952 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zkscan2G3X952 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zkscan2G3X952 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zkscan2G3X952 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zkscan2G3X952 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zkscan2G3X952 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zkscan2G3X952 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zkscan2G3X952 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zkscan2G3X952 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zkscan2G3X952 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zkscan2G3X952 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zkscan2G3X952 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zkscan2G3X952 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zkscan2G3X952 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zkscan2G3X952 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zkscan2G3X952 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zkscan2G3X952 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zkscan2G3X952 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Zkscan2G3X952 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zkscan2G3X952 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zkscan2G3X952 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zkscan2G3X952 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zkscan2G3X952 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zkscan2G3X952 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zkscan2G3X952 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zkscan2G3X952 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zkscan2G3X952 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zkscan2G3X952 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zkscan2G3X952 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zkscan2G3X952 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Zkscan2G3X952 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zkscan2G3X952 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zkscan2G3X952 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zkscan2G3X952 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zkscan2G3X952 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zkscan2G3X952 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zkscan2G3X952 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zkscan2G3X952 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zkscan2G3X952 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zkscan2G3X952 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zkscan2G3X952 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zkscan2G3X952 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zkscan2G3X952 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zkscan2G3X952 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zkscan2G3X952 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zkscan2G3X952 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zkscan2G3X952 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zkscan2G3X952 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zkscan2G3X952 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zkscan2G3X952 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zkscan2G3X952 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Zkscan2G3X952 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Zkscan2G3X952 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Zkscan2G3X952 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Zkscan2G3X952 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Zkscan2G3X952 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Zkscan2G3X952 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Zkscan2G3X952 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Zkscan2G3X952 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Zkscan2G3X952 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zkscan2G3X952 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zkscan2G3X952 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zkscan2G3X952 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zkscan2G3X952 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zkscan2G3X952 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zkscan2G3X952 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zkscan2G3X952 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zkscan2G3X952 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zkscan2G3X952 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zkscan2G3X952 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zkscan2G3X952 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zkscan2G3X952 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zkscan2G3X952 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zkscan2G3X952 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zkscan2G3X952 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zkscan2G3X952 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zkscan2G3X952 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zkscan2G3X952 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zkscan2G3X952 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zkscan2G3X952 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zkscan2G3X952 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zkscan2G3X952 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zkscan2G3X952 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zkscan2G3X952 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zkscan2G3X952 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Zkscan2G3X952 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zkscan2G3X952 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zkscan2G3X952 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zkscan2G3X952 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zkscan2G3X952 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zkscan2G3X952 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zkscan2G3X952 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zkscan2G3X952 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zkscan2G3X952 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Zkscan2G3X952 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zkscan2G3X952 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Zkscan2G3X952 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms