Protein–RNA interactions for Protein: F8VQB8

Npcd, Neuronal pentraxin chromo domain, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NpcdF8VQB8 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NpcdF8VQB8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NpcdF8VQB8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NpcdF8VQB8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NpcdF8VQB8 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NpcdF8VQB8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NpcdF8VQB8 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NpcdF8VQB8 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NpcdF8VQB8 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NpcdF8VQB8 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NpcdF8VQB8 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NpcdF8VQB8 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NpcdF8VQB8 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NpcdF8VQB8 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NpcdF8VQB8 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NpcdF8VQB8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NpcdF8VQB8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NpcdF8VQB8 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NpcdF8VQB8 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NpcdF8VQB8 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NpcdF8VQB8 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NpcdF8VQB8 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NpcdF8VQB8 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NpcdF8VQB8 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NpcdF8VQB8 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NpcdF8VQB8 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NpcdF8VQB8 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NpcdF8VQB8 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NpcdF8VQB8 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
NpcdF8VQB8 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NpcdF8VQB8 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NpcdF8VQB8 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NpcdF8VQB8 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NpcdF8VQB8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NpcdF8VQB8 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NpcdF8VQB8 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NpcdF8VQB8 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NpcdF8VQB8 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NpcdF8VQB8 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NpcdF8VQB8 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NpcdF8VQB8 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NpcdF8VQB8 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NpcdF8VQB8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NpcdF8VQB8 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NpcdF8VQB8 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NpcdF8VQB8 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NpcdF8VQB8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NpcdF8VQB8 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NpcdF8VQB8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NpcdF8VQB8 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NpcdF8VQB8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NpcdF8VQB8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NpcdF8VQB8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NpcdF8VQB8 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NpcdF8VQB8 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NpcdF8VQB8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NpcdF8VQB8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NpcdF8VQB8 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NpcdF8VQB8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NpcdF8VQB8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NpcdF8VQB8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NpcdF8VQB8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NpcdF8VQB8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NpcdF8VQB8 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NpcdF8VQB8 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NpcdF8VQB8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NpcdF8VQB8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NpcdF8VQB8 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NpcdF8VQB8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NpcdF8VQB8 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NpcdF8VQB8 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NpcdF8VQB8 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NpcdF8VQB8 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NpcdF8VQB8 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NpcdF8VQB8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NpcdF8VQB8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NpcdF8VQB8 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NpcdF8VQB8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NpcdF8VQB8 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NpcdF8VQB8 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NpcdF8VQB8 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NpcdF8VQB8 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NpcdF8VQB8 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NpcdF8VQB8 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NpcdF8VQB8 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NpcdF8VQB8 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NpcdF8VQB8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NpcdF8VQB8 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NpcdF8VQB8 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NpcdF8VQB8 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NpcdF8VQB8 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NpcdF8VQB8 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NpcdF8VQB8 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NpcdF8VQB8 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NpcdF8VQB8 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NpcdF8VQB8 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NpcdF8VQB8 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NpcdF8VQB8 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NpcdF8VQB8 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NpcdF8VQB8 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms