Protein–RNA interactions for Protein: E9PXB6

Sfta2, Surfactant-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfta2E9PXB6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sfta2E9PXB6 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sfta2E9PXB6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sfta2E9PXB6 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sfta2E9PXB6 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sfta2E9PXB6 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sfta2E9PXB6 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sfta2E9PXB6 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sfta2E9PXB6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sfta2E9PXB6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sfta2E9PXB6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sfta2E9PXB6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sfta2E9PXB6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sfta2E9PXB6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Sfta2E9PXB6 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sfta2E9PXB6 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sfta2E9PXB6 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sfta2E9PXB6 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sfta2E9PXB6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sfta2E9PXB6 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sfta2E9PXB6 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sfta2E9PXB6 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sfta2E9PXB6 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sfta2E9PXB6 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sfta2E9PXB6 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sfta2E9PXB6 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sfta2E9PXB6 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sfta2E9PXB6 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sfta2E9PXB6 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sfta2E9PXB6 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sfta2E9PXB6 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sfta2E9PXB6 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sfta2E9PXB6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sfta2E9PXB6 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sfta2E9PXB6 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sfta2E9PXB6 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sfta2E9PXB6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sfta2E9PXB6 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sfta2E9PXB6 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sfta2E9PXB6 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sfta2E9PXB6 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sfta2E9PXB6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sfta2E9PXB6 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sfta2E9PXB6 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sfta2E9PXB6 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sfta2E9PXB6 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sfta2E9PXB6 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sfta2E9PXB6 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sfta2E9PXB6 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sfta2E9PXB6 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sfta2E9PXB6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sfta2E9PXB6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sfta2E9PXB6 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sfta2E9PXB6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sfta2E9PXB6 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sfta2E9PXB6 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sfta2E9PXB6 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sfta2E9PXB6 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sfta2E9PXB6 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sfta2E9PXB6 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sfta2E9PXB6 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sfta2E9PXB6 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sfta2E9PXB6 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sfta2E9PXB6 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sfta2E9PXB6 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Sfta2E9PXB6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Sfta2E9PXB6 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Sfta2E9PXB6 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Sfta2E9PXB6 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sfta2E9PXB6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sfta2E9PXB6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sfta2E9PXB6 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sfta2E9PXB6 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sfta2E9PXB6 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sfta2E9PXB6 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sfta2E9PXB6 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sfta2E9PXB6 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sfta2E9PXB6 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sfta2E9PXB6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sfta2E9PXB6 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sfta2E9PXB6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sfta2E9PXB6 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sfta2E9PXB6 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sfta2E9PXB6 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sfta2E9PXB6 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sfta2E9PXB6 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sfta2E9PXB6 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sfta2E9PXB6 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sfta2E9PXB6 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sfta2E9PXB6 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sfta2E9PXB6 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sfta2E9PXB6 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sfta2E9PXB6 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sfta2E9PXB6 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sfta2E9PXB6 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sfta2E9PXB6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sfta2E9PXB6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sfta2E9PXB6 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sfta2E9PXB6 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sfta2E9PXB6 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms