Protein–RNA interactions for Protein: D3Z460

Gm1330, Predicted gene 1330, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm1330D3Z460 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm1330D3Z460 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm1330D3Z460 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm1330D3Z460 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm1330D3Z460 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm1330D3Z460 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm1330D3Z460 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm1330D3Z460 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm1330D3Z460 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm1330D3Z460 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm1330D3Z460 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm1330D3Z460 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm1330D3Z460 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm1330D3Z460 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm1330D3Z460 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm1330D3Z460 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm1330D3Z460 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm1330D3Z460 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm1330D3Z460 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm1330D3Z460 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm1330D3Z460 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm1330D3Z460 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm1330D3Z460 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm1330D3Z460 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm1330D3Z460 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm1330D3Z460 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm1330D3Z460 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm1330D3Z460 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm1330D3Z460 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm1330D3Z460 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm1330D3Z460 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm1330D3Z460 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm1330D3Z460 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm1330D3Z460 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm1330D3Z460 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm1330D3Z460 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gm1330D3Z460 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm1330D3Z460 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm1330D3Z460 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm1330D3Z460 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm1330D3Z460 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm1330D3Z460 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm1330D3Z460 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm1330D3Z460 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm1330D3Z460 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm1330D3Z460 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm1330D3Z460 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm1330D3Z460 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm1330D3Z460 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm1330D3Z460 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm1330D3Z460 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm1330D3Z460 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm1330D3Z460 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm1330D3Z460 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm1330D3Z460 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm1330D3Z460 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm1330D3Z460 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm1330D3Z460 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm1330D3Z460 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm1330D3Z460 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm1330D3Z460 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm1330D3Z460 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm1330D3Z460 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm1330D3Z460 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm1330D3Z460 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm1330D3Z460 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm1330D3Z460 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm1330D3Z460 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm1330D3Z460 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm1330D3Z460 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm1330D3Z460 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm1330D3Z460 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm1330D3Z460 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm1330D3Z460 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm1330D3Z460 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm1330D3Z460 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm1330D3Z460 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm1330D3Z460 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm1330D3Z460 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm1330D3Z460 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm1330D3Z460 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm1330D3Z460 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm1330D3Z460 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm1330D3Z460 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm1330D3Z460 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm1330D3Z460 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm1330D3Z460 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm1330D3Z460 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm1330D3Z460 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm1330D3Z460 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm1330D3Z460 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm1330D3Z460 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm1330D3Z460 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm1330D3Z460 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm1330D3Z460 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm1330D3Z460 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm1330D3Z460 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm1330D3Z460 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm1330D3Z460 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm1330D3Z460 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms