Protein–RNA interactions for Protein: D3YUK0

Gm3259, Predicted gene 3259, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3259D3YUK0 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Gm3259D3YUK0 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm3259D3YUK0 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm3259D3YUK0 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm3259D3YUK0 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm3259D3YUK0 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm3259D3YUK0 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm3259D3YUK0 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm3259D3YUK0 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm3259D3YUK0 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm3259D3YUK0 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm3259D3YUK0 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm3259D3YUK0 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm3259D3YUK0 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm3259D3YUK0 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm3259D3YUK0 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm3259D3YUK0 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm3259D3YUK0 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm3259D3YUK0 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm3259D3YUK0 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm3259D3YUK0 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm3259D3YUK0 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm3259D3YUK0 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm3259D3YUK0 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm3259D3YUK0 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm3259D3YUK0 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm3259D3YUK0 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm3259D3YUK0 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm3259D3YUK0 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm3259D3YUK0 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm3259D3YUK0 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm3259D3YUK0 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm3259D3YUK0 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm3259D3YUK0 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm3259D3YUK0 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm3259D3YUK0 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm3259D3YUK0 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm3259D3YUK0 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm3259D3YUK0 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm3259D3YUK0 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm3259D3YUK0 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm3259D3YUK0 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm3259D3YUK0 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm3259D3YUK0 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm3259D3YUK0 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm3259D3YUK0 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm3259D3YUK0 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm3259D3YUK0 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm3259D3YUK0 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm3259D3YUK0 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm3259D3YUK0 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm3259D3YUK0 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm3259D3YUK0 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm3259D3YUK0 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm3259D3YUK0 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm3259D3YUK0 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm3259D3YUK0 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm3259D3YUK0 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm3259D3YUK0 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm3259D3YUK0 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm3259D3YUK0 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm3259D3YUK0 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm3259D3YUK0 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm3259D3YUK0 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm3259D3YUK0 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm3259D3YUK0 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm3259D3YUK0 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm3259D3YUK0 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm3259D3YUK0 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm3259D3YUK0 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm3259D3YUK0 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm3259D3YUK0 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm3259D3YUK0 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm3259D3YUK0 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm3259D3YUK0 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm3259D3YUK0 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm3259D3YUK0 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm3259D3YUK0 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm3259D3YUK0 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm3259D3YUK0 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gm3259D3YUK0 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gm3259D3YUK0 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gm3259D3YUK0 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gm3259D3YUK0 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gm3259D3YUK0 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gm3259D3YUK0 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gm3259D3YUK0 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gm3259D3YUK0 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gm3259D3YUK0 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm3259D3YUK0 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm3259D3YUK0 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm3259D3YUK0 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm3259D3YUK0 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm3259D3YUK0 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm3259D3YUK0 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm3259D3YUK0 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm3259D3YUK0 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm3259D3YUK0 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm3259D3YUK0 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm3259D3YUK0 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms