Protein–RNA interactions for Protein: B1B0V2

AU022751, Expressed sequence AU022751, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU022751B1B0V2 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
AU022751B1B0V2 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
AU022751B1B0V2 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
AU022751B1B0V2 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
AU022751B1B0V2 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
AU022751B1B0V2 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
AU022751B1B0V2 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
AU022751B1B0V2 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
AU022751B1B0V2 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
AU022751B1B0V2 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
AU022751B1B0V2 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
AU022751B1B0V2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
AU022751B1B0V2 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
AU022751B1B0V2 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
AU022751B1B0V2 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
AU022751B1B0V2 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
AU022751B1B0V2 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
AU022751B1B0V2 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
AU022751B1B0V2 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
AU022751B1B0V2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
AU022751B1B0V2 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
AU022751B1B0V2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
AU022751B1B0V2 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
AU022751B1B0V2 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
AU022751B1B0V2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
AU022751B1B0V2 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
AU022751B1B0V2 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
AU022751B1B0V2 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
AU022751B1B0V2 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
AU022751B1B0V2 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
AU022751B1B0V2 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
AU022751B1B0V2 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
AU022751B1B0V2 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
AU022751B1B0V2 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
AU022751B1B0V2 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
AU022751B1B0V2 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
AU022751B1B0V2 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
AU022751B1B0V2 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
AU022751B1B0V2 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
AU022751B1B0V2 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
AU022751B1B0V2 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
AU022751B1B0V2 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
AU022751B1B0V2 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
AU022751B1B0V2 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
AU022751B1B0V2 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
AU022751B1B0V2 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
AU022751B1B0V2 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
AU022751B1B0V2 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
AU022751B1B0V2 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
AU022751B1B0V2 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
AU022751B1B0V2 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
AU022751B1B0V2 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
AU022751B1B0V2 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
AU022751B1B0V2 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
AU022751B1B0V2 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
AU022751B1B0V2 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
AU022751B1B0V2 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
AU022751B1B0V2 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
AU022751B1B0V2 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
AU022751B1B0V2 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
AU022751B1B0V2 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
AU022751B1B0V2 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
AU022751B1B0V2 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
AU022751B1B0V2 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
AU022751B1B0V2 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
AU022751B1B0V2 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
AU022751B1B0V2 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
AU022751B1B0V2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
AU022751B1B0V2 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
AU022751B1B0V2 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
AU022751B1B0V2 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
AU022751B1B0V2 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
AU022751B1B0V2 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
AU022751B1B0V2 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
AU022751B1B0V2 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
AU022751B1B0V2 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
AU022751B1B0V2 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
AU022751B1B0V2 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
AU022751B1B0V2 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
AU022751B1B0V2 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
AU022751B1B0V2 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
AU022751B1B0V2 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
AU022751B1B0V2 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
AU022751B1B0V2 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
AU022751B1B0V2 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
AU022751B1B0V2 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
AU022751B1B0V2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
AU022751B1B0V2 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
AU022751B1B0V2 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
AU022751B1B0V2 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
AU022751B1B0V2 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
AU022751B1B0V2 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
AU022751B1B0V2 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
AU022751B1B0V2 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
AU022751B1B0V2 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
AU022751B1B0V2 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
AU022751B1B0V2 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
AU022751B1B0V2 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
AU022751B1B0V2 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
AU022751B1B0V2 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms