Protein–RNA interactions for Protein: A6NI28

ARHGAP42, Rho GTPase-activating protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP42A6NI28 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGAP42A6NI28 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGAP42A6NI28 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGAP42A6NI28 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGAP42A6NI28 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGAP42A6NI28 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGAP42A6NI28 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGAP42A6NI28 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGAP42A6NI28 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGAP42A6NI28 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGAP42A6NI28 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGAP42A6NI28 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGAP42A6NI28 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGAP42A6NI28 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGAP42A6NI28 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGAP42A6NI28 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGAP42A6NI28 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGAP42A6NI28 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGAP42A6NI28 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGAP42A6NI28 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGAP42A6NI28 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGAP42A6NI28 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGAP42A6NI28 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARHGAP42A6NI28 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARHGAP42A6NI28 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARHGAP42A6NI28 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARHGAP42A6NI28 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ARHGAP42A6NI28 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARHGAP42A6NI28 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARHGAP42A6NI28 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ARHGAP42A6NI28 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARHGAP42A6NI28 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARHGAP42A6NI28 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARHGAP42A6NI28 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARHGAP42A6NI28 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARHGAP42A6NI28 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARHGAP42A6NI28 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARHGAP42A6NI28 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ARHGAP42A6NI28 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ARHGAP42A6NI28 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ARHGAP42A6NI28 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ARHGAP42A6NI28 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARHGAP42A6NI28 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARHGAP42A6NI28 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARHGAP42A6NI28 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARHGAP42A6NI28 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARHGAP42A6NI28 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARHGAP42A6NI28 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARHGAP42A6NI28 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARHGAP42A6NI28 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARHGAP42A6NI28 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARHGAP42A6NI28 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARHGAP42A6NI28 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARHGAP42A6NI28 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARHGAP42A6NI28 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARHGAP42A6NI28 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARHGAP42A6NI28 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARHGAP42A6NI28 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARHGAP42A6NI28 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ARHGAP42A6NI28 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARHGAP42A6NI28 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARHGAP42A6NI28 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ARHGAP42A6NI28 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARHGAP42A6NI28 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARHGAP42A6NI28 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARHGAP42A6NI28 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARHGAP42A6NI28 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARHGAP42A6NI28 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARHGAP42A6NI28 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARHGAP42A6NI28 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARHGAP42A6NI28 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARHGAP42A6NI28 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARHGAP42A6NI28 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARHGAP42A6NI28 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARHGAP42A6NI28 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARHGAP42A6NI28 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARHGAP42A6NI28 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARHGAP42A6NI28 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARHGAP42A6NI28 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARHGAP42A6NI28 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARHGAP42A6NI28 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARHGAP42A6NI28 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ARHGAP42A6NI28 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARHGAP42A6NI28 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARHGAP42A6NI28 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARHGAP42A6NI28 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARHGAP42A6NI28 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARHGAP42A6NI28 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARHGAP42A6NI28 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARHGAP42A6NI28 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARHGAP42A6NI28 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARHGAP42A6NI28 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARHGAP42A6NI28 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARHGAP42A6NI28 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARHGAP42A6NI28 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARHGAP42A6NI28 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARHGAP42A6NI28 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARHGAP42A6NI28 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ARHGAP42A6NI28 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARHGAP42A6NI28 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms