Protein–RNA interactions for Protein: A3KMN5

Prr16, Protein Largen, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr16A3KMN5 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prr16A3KMN5 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prr16A3KMN5 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prr16A3KMN5 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prr16A3KMN5 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prr16A3KMN5 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prr16A3KMN5 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prr16A3KMN5 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prr16A3KMN5 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prr16A3KMN5 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prr16A3KMN5 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prr16A3KMN5 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prr16A3KMN5 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prr16A3KMN5 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prr16A3KMN5 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prr16A3KMN5 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prr16A3KMN5 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Prr16A3KMN5 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prr16A3KMN5 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prr16A3KMN5 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prr16A3KMN5 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prr16A3KMN5 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prr16A3KMN5 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prr16A3KMN5 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prr16A3KMN5 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prr16A3KMN5 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prr16A3KMN5 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prr16A3KMN5 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Prr16A3KMN5 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prr16A3KMN5 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prr16A3KMN5 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prr16A3KMN5 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prr16A3KMN5 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prr16A3KMN5 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prr16A3KMN5 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prr16A3KMN5 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prr16A3KMN5 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prr16A3KMN5 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prr16A3KMN5 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prr16A3KMN5 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prr16A3KMN5 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prr16A3KMN5 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prr16A3KMN5 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prr16A3KMN5 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Prr16A3KMN5 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prr16A3KMN5 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prr16A3KMN5 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prr16A3KMN5 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prr16A3KMN5 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prr16A3KMN5 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prr16A3KMN5 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prr16A3KMN5 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prr16A3KMN5 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prr16A3KMN5 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Prr16A3KMN5 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prr16A3KMN5 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Prr16A3KMN5 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prr16A3KMN5 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prr16A3KMN5 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prr16A3KMN5 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prr16A3KMN5 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prr16A3KMN5 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prr16A3KMN5 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prr16A3KMN5 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prr16A3KMN5 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Prr16A3KMN5 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prr16A3KMN5 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prr16A3KMN5 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prr16A3KMN5 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prr16A3KMN5 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prr16A3KMN5 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prr16A3KMN5 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prr16A3KMN5 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prr16A3KMN5 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prr16A3KMN5 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prr16A3KMN5 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prr16A3KMN5 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prr16A3KMN5 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Prr16A3KMN5 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prr16A3KMN5 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prr16A3KMN5 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prr16A3KMN5 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prr16A3KMN5 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prr16A3KMN5 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prr16A3KMN5 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prr16A3KMN5 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prr16A3KMN5 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prr16A3KMN5 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prr16A3KMN5 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Prr16A3KMN5 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Prr16A3KMN5 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prr16A3KMN5 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Prr16A3KMN5 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prr16A3KMN5 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prr16A3KMN5 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prr16A3KMN5 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prr16A3KMN5 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prr16A3KMN5 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prr16A3KMN5 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prr16A3KMN5 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms