Protein–RNA interactions for Protein: A2ASJ1

Pramef17, PRAME family member 17, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef17A2ASJ1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pramef17A2ASJ1 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pramef17A2ASJ1 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pramef17A2ASJ1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pramef17A2ASJ1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pramef17A2ASJ1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pramef17A2ASJ1 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pramef17A2ASJ1 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pramef17A2ASJ1 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pramef17A2ASJ1 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pramef17A2ASJ1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Pramef17A2ASJ1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pramef17A2ASJ1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pramef17A2ASJ1 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pramef17A2ASJ1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pramef17A2ASJ1 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pramef17A2ASJ1 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pramef17A2ASJ1 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pramef17A2ASJ1 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pramef17A2ASJ1 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pramef17A2ASJ1 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pramef17A2ASJ1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pramef17A2ASJ1 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pramef17A2ASJ1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pramef17A2ASJ1 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pramef17A2ASJ1 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pramef17A2ASJ1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pramef17A2ASJ1 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pramef17A2ASJ1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pramef17A2ASJ1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pramef17A2ASJ1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pramef17A2ASJ1 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pramef17A2ASJ1 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pramef17A2ASJ1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pramef17A2ASJ1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pramef17A2ASJ1 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pramef17A2ASJ1 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pramef17A2ASJ1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pramef17A2ASJ1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pramef17A2ASJ1 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pramef17A2ASJ1 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pramef17A2ASJ1 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pramef17A2ASJ1 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pramef17A2ASJ1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pramef17A2ASJ1 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pramef17A2ASJ1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pramef17A2ASJ1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pramef17A2ASJ1 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pramef17A2ASJ1 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pramef17A2ASJ1 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pramef17A2ASJ1 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pramef17A2ASJ1 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pramef17A2ASJ1 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pramef17A2ASJ1 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Pramef17A2ASJ1 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pramef17A2ASJ1 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pramef17A2ASJ1 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pramef17A2ASJ1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pramef17A2ASJ1 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pramef17A2ASJ1 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Pramef17A2ASJ1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pramef17A2ASJ1 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pramef17A2ASJ1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pramef17A2ASJ1 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pramef17A2ASJ1 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pramef17A2ASJ1 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pramef17A2ASJ1 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pramef17A2ASJ1 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pramef17A2ASJ1 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pramef17A2ASJ1 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pramef17A2ASJ1 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Pramef17A2ASJ1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Pramef17A2ASJ1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pramef17A2ASJ1 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pramef17A2ASJ1 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Pramef17A2ASJ1 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pramef17A2ASJ1 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pramef17A2ASJ1 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pramef17A2ASJ1 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Pramef17A2ASJ1 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pramef17A2ASJ1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pramef17A2ASJ1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pramef17A2ASJ1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pramef17A2ASJ1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pramef17A2ASJ1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pramef17A2ASJ1 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pramef17A2ASJ1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pramef17A2ASJ1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Pramef17A2ASJ1 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Pramef17A2ASJ1 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pramef17A2ASJ1 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Pramef17A2ASJ1 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pramef17A2ASJ1 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pramef17A2ASJ1 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pramef17A2ASJ1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pramef17A2ASJ1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pramef17A2ASJ1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pramef17A2ASJ1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pramef17A2ASJ1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pramef17A2ASJ1 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms