Protein–RNA interactions for Protein: V9GX38

Gm17190, Predicted gene 17190, mousemouse

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Length 357 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17190V9GX38 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm17190V9GX38 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm17190V9GX38 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm17190V9GX38 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm17190V9GX38 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm17190V9GX38 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm17190V9GX38 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm17190V9GX38 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm17190V9GX38 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm17190V9GX38 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm17190V9GX38 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm17190V9GX38 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm17190V9GX38 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm17190V9GX38 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm17190V9GX38 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm17190V9GX38 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm17190V9GX38 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm17190V9GX38 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm17190V9GX38 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gm17190V9GX38 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gm17190V9GX38 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gm17190V9GX38 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm17190V9GX38 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm17190V9GX38 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm17190V9GX38 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm17190V9GX38 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm17190V9GX38 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm17190V9GX38 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm17190V9GX38 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm17190V9GX38 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm17190V9GX38 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm17190V9GX38 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm17190V9GX38 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm17190V9GX38 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm17190V9GX38 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm17190V9GX38 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm17190V9GX38 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm17190V9GX38 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm17190V9GX38 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm17190V9GX38 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm17190V9GX38 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm17190V9GX38 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm17190V9GX38 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm17190V9GX38 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm17190V9GX38 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm17190V9GX38 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm17190V9GX38 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm17190V9GX38 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm17190V9GX38 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm17190V9GX38 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm17190V9GX38 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm17190V9GX38 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm17190V9GX38 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm17190V9GX38 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm17190V9GX38 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm17190V9GX38 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm17190V9GX38 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm17190V9GX38 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm17190V9GX38 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm17190V9GX38 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm17190V9GX38 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm17190V9GX38 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm17190V9GX38 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm17190V9GX38 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm17190V9GX38 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm17190V9GX38 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm17190V9GX38 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm17190V9GX38 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm17190V9GX38 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm17190V9GX38 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm17190V9GX38 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm17190V9GX38 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm17190V9GX38 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm17190V9GX38 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm17190V9GX38 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm17190V9GX38 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm17190V9GX38 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm17190V9GX38 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm17190V9GX38 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm17190V9GX38 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm17190V9GX38 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm17190V9GX38 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm17190V9GX38 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm17190V9GX38 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm17190V9GX38 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gm17190V9GX38 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm17190V9GX38 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm17190V9GX38 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm17190V9GX38 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm17190V9GX38 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm17190V9GX38 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm17190V9GX38 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm17190V9GX38 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm17190V9GX38 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm17190V9GX38 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm17190V9GX38 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm17190V9GX38 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm17190V9GX38 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm17190V9GX38 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm17190V9GX38 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
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