Protein–RNA interactions for Protein: S4R181

Ccdc166, Coiled-coil domain-containing 166, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc166S4R181 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc166S4R181 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc166S4R181 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc166S4R181 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccdc166S4R181 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc166S4R181 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc166S4R181 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc166S4R181 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc166S4R181 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc166S4R181 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc166S4R181 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc166S4R181 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc166S4R181 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc166S4R181 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc166S4R181 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc166S4R181 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc166S4R181 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc166S4R181 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc166S4R181 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc166S4R181 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc166S4R181 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc166S4R181 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc166S4R181 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc166S4R181 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc166S4R181 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc166S4R181 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc166S4R181 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc166S4R181 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc166S4R181 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc166S4R181 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc166S4R181 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc166S4R181 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc166S4R181 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc166S4R181 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc166S4R181 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc166S4R181 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc166S4R181 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc166S4R181 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc166S4R181 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc166S4R181 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc166S4R181 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc166S4R181 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ccdc166S4R181 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc166S4R181 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc166S4R181 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc166S4R181 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc166S4R181 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc166S4R181 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc166S4R181 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc166S4R181 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc166S4R181 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc166S4R181 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc166S4R181 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc166S4R181 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc166S4R181 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc166S4R181 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc166S4R181 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc166S4R181 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc166S4R181 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc166S4R181 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc166S4R181 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc166S4R181 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc166S4R181 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc166S4R181 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc166S4R181 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc166S4R181 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc166S4R181 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc166S4R181 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc166S4R181 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc166S4R181 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc166S4R181 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc166S4R181 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc166S4R181 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc166S4R181 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc166S4R181 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc166S4R181 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc166S4R181 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc166S4R181 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc166S4R181 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc166S4R181 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc166S4R181 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc166S4R181 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc166S4R181 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc166S4R181 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc166S4R181 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc166S4R181 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc166S4R181 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc166S4R181 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc166S4R181 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc166S4R181 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc166S4R181 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc166S4R181 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc166S4R181 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc166S4R181 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc166S4R181 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc166S4R181 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc166S4R181 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc166S4R181 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc166S4R181 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc166S4R181 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms