Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2B9

Rps6ka4, Ribosomal protein S6 kinase alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka4Q9Z2B9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC33,27■■■□□ 2,92
Rps6ka4Q9Z2B9 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,24■■■□□ 2,91
Rps6ka4Q9Z2B9 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,24■■■□□ 2,91
Rps6ka4Q9Z2B9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,22■■■□□ 2,91
Rps6ka4Q9Z2B9 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,21■■■□□ 2,91
Rps6ka4Q9Z2B9 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,21■■■□□ 2,91
Rps6ka4Q9Z2B9 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC33,2■■■□□ 2,91
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC33,19■■■□□ 2,9
Rps6ka4Q9Z2B9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,18■■■□□ 2,9
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC33,18■■■□□ 2,9
Rps6ka4Q9Z2B9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC33,17■■■□□ 2,9
Rps6ka4Q9Z2B9 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC33,17■■■□□ 2,9
Rps6ka4Q9Z2B9 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33,17■■■□□ 2,9
Rps6ka4Q9Z2B9 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,16■■■□□ 2,9
Rps6ka4Q9Z2B9 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,15■■■□□ 2,9
Rps6ka4Q9Z2B9 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,14■■■□□ 2,89
Rps6ka4Q9Z2B9 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33,13■■■□□ 2,89
Rps6ka4Q9Z2B9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,12■■■□□ 2,89
Rps6ka4Q9Z2B9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC33,12■■■□□ 2,89
Rps6ka4Q9Z2B9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,1■■■□□ 2,89
Rps6ka4Q9Z2B9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33,07■■■□□ 2,88
Rps6ka4Q9Z2B9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33,06■■■□□ 2,88
Rps6ka4Q9Z2B9 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,06■■■□□ 2,88
Rps6ka4Q9Z2B9 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC33,05■■■□□ 2,88
Rps6ka4Q9Z2B9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,05■■■□□ 2,88
Rps6ka4Q9Z2B9 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33,04■■■□□ 2,88
Rps6ka4Q9Z2B9 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,02■■■□□ 2,88
Rps6ka4Q9Z2B9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2,87
Rps6ka4Q9Z2B9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32,97■■■□□ 2,87
Rps6ka4Q9Z2B9 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC32,93■■■□□ 2,86
Rps6ka4Q9Z2B9 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC32,93■■■□□ 2,86
Rps6ka4Q9Z2B9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,92■■■□□ 2,86
Rps6ka4Q9Z2B9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,92■■■□□ 2,86
Rps6ka4Q9Z2B9 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC32,91■■■□□ 2,86
Rps6ka4Q9Z2B9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC32,9■■■□□ 2,86
Rps6ka4Q9Z2B9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC32,9■■■□□ 2,86
Rps6ka4Q9Z2B9 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32,9■■■□□ 2,86
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC32,87■■■□□ 2,85
Rps6ka4Q9Z2B9 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,86■■■□□ 2,85
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC32,85■■■□□ 2,85
Rps6ka4Q9Z2B9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,85■■■□□ 2,85
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC32,85■■■□□ 2,85
Rps6ka4Q9Z2B9 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,85■■■□□ 2,85
Rps6ka4Q9Z2B9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,84■■■□□ 2,85
Rps6ka4Q9Z2B9 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,84■■■□□ 2,85
Rps6ka4Q9Z2B9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32,83■■■□□ 2,85
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC32,82■■■□□ 2,84
Rps6ka4Q9Z2B9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,82■■■□□ 2,84
Rps6ka4Q9Z2B9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC32,81■■■□□ 2,84
Rps6ka4Q9Z2B9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,81■■■□□ 2,84
Rps6ka4Q9Z2B9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC32,8■■■□□ 2,84
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC32,8■■■□□ 2,84
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC32,79■■■□□ 2,84
Rps6ka4Q9Z2B9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,78■■■□□ 2,84
Rps6ka4Q9Z2B9 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC32,75■■■□□ 2,83
Rps6ka4Q9Z2B9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32,73■■■□□ 2,83
Rps6ka4Q9Z2B9 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,73■■■□□ 2,83
Rps6ka4Q9Z2B9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC32,72■■■□□ 2,83
Rps6ka4Q9Z2B9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,72■■■□□ 2,83
Rps6ka4Q9Z2B9 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,72■■■□□ 2,83
Rps6ka4Q9Z2B9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32,72■■■□□ 2,83
Rps6ka4Q9Z2B9 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC32,7■■■□□ 2,82
Rps6ka4Q9Z2B9 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC32,69■■■□□ 2,82
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC32,69■■■□□ 2,82
Rps6ka4Q9Z2B9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC32,67■■■□□ 2,82
Rps6ka4Q9Z2B9 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC32,66■■■□□ 2,82
Rps6ka4Q9Z2B9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC32,65■■■□□ 2,82
Rps6ka4Q9Z2B9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,65■■■□□ 2,82
Rps6ka4Q9Z2B9 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,65■■■□□ 2,82
Rps6ka4Q9Z2B9 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,65■■■□□ 2,82
Rps6ka4Q9Z2B9 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC32,64■■■□□ 2,82
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC32,63■■■□□ 2,81
Rps6ka4Q9Z2B9 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC32,63■■■□□ 2,81
Rps6ka4Q9Z2B9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,61■■■□□ 2,81
Rps6ka4Q9Z2B9 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,59■■■□□ 2,81
Rps6ka4Q9Z2B9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC32,59■■■□□ 2,81
Rps6ka4Q9Z2B9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,58■■■□□ 2,81
Rps6ka4Q9Z2B9 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,58■■■□□ 2,81
Rps6ka4Q9Z2B9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC32,58■■■□□ 2,81
Rps6ka4Q9Z2B9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC32,58■■■□□ 2,81
Rps6ka4Q9Z2B9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC32,57■■■□□ 2,8
Rps6ka4Q9Z2B9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,56■■■□□ 2,8
Rps6ka4Q9Z2B9 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,55■■■□□ 2,8
Rps6ka4Q9Z2B9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC32,55■■■□□ 2,8
Rps6ka4Q9Z2B9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC32,55■■■□□ 2,8
Rps6ka4Q9Z2B9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,54■■■□□ 2,8
Rps6ka4Q9Z2B9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32,54■■■□□ 2,8
Rps6ka4Q9Z2B9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC32,53■■■□□ 2,8
Rps6ka4Q9Z2B9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC32,53■■■□□ 2,8
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC32,52■■■□□ 2,8
Rps6ka4Q9Z2B9 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32,52■■■□□ 2,8
Rps6ka4Q9Z2B9 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,52■■■□□ 2,8
Rps6ka4Q9Z2B9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,51■■■□□ 2,8
Rps6ka4Q9Z2B9 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,51■■■□□ 2,8
Rps6ka4Q9Z2B9 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32,51■■■□□ 2,79
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC32,49■■■□□ 2,79
Rps6ka4Q9Z2B9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,48■■■□□ 2,79
Rps6ka4Q9Z2B9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32,48■■■□□ 2,79
Rps6ka4Q9Z2B9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32,48■■■□□ 2,79
Rps6ka4Q9Z2B9 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC32,48■■■□□ 2,79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17,7 ms