Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z273

Tulp1, Tubby-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tulp1Q9Z273 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,75■■■□□ 2,19
Tulp1Q9Z273 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,75■■■□□ 2,19
Tulp1Q9Z273 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28,74■■■□□ 2,19
Tulp1Q9Z273 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,73■■■□□ 2,19
Tulp1Q9Z273 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28,73■■■□□ 2,19
Tulp1Q9Z273 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,72■■■□□ 2,19
Tulp1Q9Z273 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28,71■■■□□ 2,19
Tulp1Q9Z273 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,7■■■□□ 2,18
Tulp1Q9Z273 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC28,7■■■□□ 2,18
Tulp1Q9Z273 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28,68■■■□□ 2,18
Tulp1Q9Z273 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28,68■■■□□ 2,18
Tulp1Q9Z273 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,68■■■□□ 2,18
Tulp1Q9Z273 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,67■■■□□ 2,18
Tulp1Q9Z273 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28,67■■■□□ 2,18
Tulp1Q9Z273 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28,67■■■□□ 2,18
Tulp1Q9Z273 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,66■■■□□ 2,18
Tulp1Q9Z273 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28,66■■■□□ 2,18
Tulp1Q9Z273 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28,63■■■□□ 2,17
Tulp1Q9Z273 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,63■■■□□ 2,17
Tulp1Q9Z273 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28,63■■■□□ 2,17
Tulp1Q9Z273 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28,63■■■□□ 2,17
Tulp1Q9Z273 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28,62■■■□□ 2,17
Tulp1Q9Z273 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28,61■■■□□ 2,17
Tulp1Q9Z273 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,61■■■□□ 2,17
Tulp1Q9Z273 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,61■■■□□ 2,17
Tulp1Q9Z273 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28,6■■■□□ 2,17
Tulp1Q9Z273 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28,6■■■□□ 2,17
Tulp1Q9Z273 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28,6■■■□□ 2,17
Tulp1Q9Z273 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,58■■■□□ 2,17
Tulp1Q9Z273 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,57■■■□□ 2,16
Tulp1Q9Z273 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28,57■■■□□ 2,16
Tulp1Q9Z273 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28,57■■■□□ 2,16
Tulp1Q9Z273 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,56■■■□□ 2,16
Tulp1Q9Z273 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28,55■■■□□ 2,16
Tulp1Q9Z273 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28,54■■■□□ 2,16
Tulp1Q9Z273 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,52■■■□□ 2,16
Tulp1Q9Z273 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,52■■■□□ 2,16
Tulp1Q9Z273 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,51■■■□□ 2,16
Tulp1Q9Z273 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28,51■■■□□ 2,15
Tulp1Q9Z273 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28,49■■■□□ 2,15
Tulp1Q9Z273 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,48■■■□□ 2,15
Tulp1Q9Z273 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,48■■■□□ 2,15
Tulp1Q9Z273 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28,47■■■□□ 2,15
Tulp1Q9Z273 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28,44■■■□□ 2,14
Tulp1Q9Z273 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,43■■■□□ 2,14
Tulp1Q9Z273 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,43■■■□□ 2,14
Tulp1Q9Z273 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,42■■■□□ 2,14
Tulp1Q9Z273 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,42■■■□□ 2,14
Tulp1Q9Z273 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,42■■■□□ 2,14
Tulp1Q9Z273 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,41■■■□□ 2,14
Tulp1Q9Z273 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,41■■■□□ 2,14
Tulp1Q9Z273 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC28,4■■■□□ 2,14
Tulp1Q9Z273 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC28,39■■■□□ 2,14
Tulp1Q9Z273 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,39■■■□□ 2,13
Tulp1Q9Z273 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28,38■■■□□ 2,13
Tulp1Q9Z273 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28,38■■■□□ 2,13
Tulp1Q9Z273 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,38■■■□□ 2,13
Tulp1Q9Z273 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28,38■■■□□ 2,13
Tulp1Q9Z273 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28,38■■■□□ 2,13
Tulp1Q9Z273 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,37■■■□□ 2,13
Tulp1Q9Z273 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28,37■■■□□ 2,13
Tulp1Q9Z273 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC28,37■■■□□ 2,13
Tulp1Q9Z273 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,36■■■□□ 2,13
Tulp1Q9Z273 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28,36■■■□□ 2,13
Tulp1Q9Z273 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,36■■■□□ 2,13
Tulp1Q9Z273 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,35■■■□□ 2,13
Tulp1Q9Z273 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC28,35■■■□□ 2,13
Tulp1Q9Z273 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,34■■■□□ 2,13
Tulp1Q9Z273 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28,33■■■□□ 2,13
Tulp1Q9Z273 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28,33■■■□□ 2,13
Tulp1Q9Z273 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28,32■■■□□ 2,12
Tulp1Q9Z273 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,31■■■□□ 2,12
Tulp1Q9Z273 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,31■■■□□ 2,12
Tulp1Q9Z273 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28,3■■■□□ 2,12
Tulp1Q9Z273 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,3■■■□□ 2,12
Tulp1Q9Z273 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,3■■■□□ 2,12
Tulp1Q9Z273 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,29■■■□□ 2,12
Tulp1Q9Z273 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC28,29■■■□□ 2,12
Tulp1Q9Z273 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28,26■■■□□ 2,12
Tulp1Q9Z273 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,26■■■□□ 2,11
Tulp1Q9Z273 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,26■■■□□ 2,11
Tulp1Q9Z273 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,26■■■□□ 2,11
Tulp1Q9Z273 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,25■■■□□ 2,11
Tulp1Q9Z273 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,23■■■□□ 2,11
Tulp1Q9Z273 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,23■■■□□ 2,11
Tulp1Q9Z273 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28,23■■■□□ 2,11
Tulp1Q9Z273 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28,22■■■□□ 2,11
Tulp1Q9Z273 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,21■■■□□ 2,11
Tulp1Q9Z273 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,2■■■□□ 2,1
Tulp1Q9Z273 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28,19■■■□□ 2,1
Tulp1Q9Z273 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,18■■■□□ 2,1
Tulp1Q9Z273 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28,18■■■□□ 2,1
Tulp1Q9Z273 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,18■■■□□ 2,1
Tulp1Q9Z273 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,17■■■□□ 2,1
Tulp1Q9Z273 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28,15■■■□□ 2,1
Tulp1Q9Z273 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,14■■■□□ 2,09
Tulp1Q9Z273 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC28,14■■■□□ 2,09
Tulp1Q9Z273 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28,13■■■□□ 2,09
Tulp1Q9Z273 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28,12■■■□□ 2,09
Tulp1Q9Z273 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,12■■■□□ 2,09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21,7 ms