Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Z0

Uso1, General vesicular transport factor p115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uso1Q9Z1Z0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Uso1Q9Z1Z0 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Uso1Q9Z1Z0 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Uso1Q9Z1Z0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Uso1Q9Z1Z0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Uso1Q9Z1Z0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Uso1Q9Z1Z0 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Uso1Q9Z1Z0 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Uso1Q9Z1Z0 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Uso1Q9Z1Z0 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Uso1Q9Z1Z0 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Uso1Q9Z1Z0 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Uso1Q9Z1Z0 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Uso1Q9Z1Z0 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Uso1Q9Z1Z0 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Uso1Q9Z1Z0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Uso1Q9Z1Z0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Uso1Q9Z1Z0 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Uso1Q9Z1Z0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Uso1Q9Z1Z0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Uso1Q9Z1Z0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Uso1Q9Z1Z0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Uso1Q9Z1Z0 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Uso1Q9Z1Z0 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Uso1Q9Z1Z0 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Uso1Q9Z1Z0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Uso1Q9Z1Z0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Uso1Q9Z1Z0 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Uso1Q9Z1Z0 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Uso1Q9Z1Z0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Uso1Q9Z1Z0 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Uso1Q9Z1Z0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Uso1Q9Z1Z0 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Uso1Q9Z1Z0 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Uso1Q9Z1Z0 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Uso1Q9Z1Z0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Uso1Q9Z1Z0 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Uso1Q9Z1Z0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Uso1Q9Z1Z0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Uso1Q9Z1Z0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Uso1Q9Z1Z0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Uso1Q9Z1Z0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Uso1Q9Z1Z0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Uso1Q9Z1Z0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Uso1Q9Z1Z0 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Uso1Q9Z1Z0 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Uso1Q9Z1Z0 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Uso1Q9Z1Z0 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Uso1Q9Z1Z0 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Uso1Q9Z1Z0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Uso1Q9Z1Z0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Uso1Q9Z1Z0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Uso1Q9Z1Z0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Uso1Q9Z1Z0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Uso1Q9Z1Z0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Uso1Q9Z1Z0 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Uso1Q9Z1Z0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Uso1Q9Z1Z0 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Uso1Q9Z1Z0 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Uso1Q9Z1Z0 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Uso1Q9Z1Z0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Uso1Q9Z1Z0 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Uso1Q9Z1Z0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Uso1Q9Z1Z0 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Uso1Q9Z1Z0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Uso1Q9Z1Z0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Uso1Q9Z1Z0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Uso1Q9Z1Z0 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Uso1Q9Z1Z0 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Uso1Q9Z1Z0 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Uso1Q9Z1Z0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Uso1Q9Z1Z0 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Uso1Q9Z1Z0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Uso1Q9Z1Z0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Uso1Q9Z1Z0 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Uso1Q9Z1Z0 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Uso1Q9Z1Z0 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Uso1Q9Z1Z0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Uso1Q9Z1Z0 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Uso1Q9Z1Z0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Uso1Q9Z1Z0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Uso1Q9Z1Z0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Uso1Q9Z1Z0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Uso1Q9Z1Z0 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Uso1Q9Z1Z0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Uso1Q9Z1Z0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Uso1Q9Z1Z0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Uso1Q9Z1Z0 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Uso1Q9Z1Z0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Uso1Q9Z1Z0 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Uso1Q9Z1Z0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Uso1Q9Z1Z0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Uso1Q9Z1Z0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Uso1Q9Z1Z0 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Uso1Q9Z1Z0 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Uso1Q9Z1Z0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Uso1Q9Z1Z0 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Uso1Q9Z1Z0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Uso1Q9Z1Z0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Uso1Q9Z1Z0 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms