Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z160

Cog1, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog1Q9Z160 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cog1Q9Z160 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cog1Q9Z160 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Cog1Q9Z160 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cog1Q9Z160 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cog1Q9Z160 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cog1Q9Z160 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Cog1Q9Z160 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cog1Q9Z160 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cog1Q9Z160 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cog1Q9Z160 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cog1Q9Z160 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cog1Q9Z160 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cog1Q9Z160 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cog1Q9Z160 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cog1Q9Z160 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cog1Q9Z160 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cog1Q9Z160 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cog1Q9Z160 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cog1Q9Z160 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Cog1Q9Z160 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cog1Q9Z160 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cog1Q9Z160 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cog1Q9Z160 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Cog1Q9Z160 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cog1Q9Z160 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cog1Q9Z160 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cog1Q9Z160 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cog1Q9Z160 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cog1Q9Z160 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cog1Q9Z160 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cog1Q9Z160 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cog1Q9Z160 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cog1Q9Z160 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cog1Q9Z160 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cog1Q9Z160 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cog1Q9Z160 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cog1Q9Z160 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cog1Q9Z160 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cog1Q9Z160 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cog1Q9Z160 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cog1Q9Z160 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Cog1Q9Z160 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cog1Q9Z160 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cog1Q9Z160 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cog1Q9Z160 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cog1Q9Z160 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cog1Q9Z160 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cog1Q9Z160 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cog1Q9Z160 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cog1Q9Z160 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cog1Q9Z160 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Cog1Q9Z160 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cog1Q9Z160 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Cog1Q9Z160 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cog1Q9Z160 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cog1Q9Z160 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cog1Q9Z160 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cog1Q9Z160 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cog1Q9Z160 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cog1Q9Z160 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cog1Q9Z160 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cog1Q9Z160 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cog1Q9Z160 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cog1Q9Z160 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cog1Q9Z160 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cog1Q9Z160 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cog1Q9Z160 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cog1Q9Z160 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cog1Q9Z160 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cog1Q9Z160 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cog1Q9Z160 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cog1Q9Z160 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cog1Q9Z160 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cog1Q9Z160 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cog1Q9Z160 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cog1Q9Z160 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cog1Q9Z160 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cog1Q9Z160 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cog1Q9Z160 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cog1Q9Z160 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cog1Q9Z160 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cog1Q9Z160 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cog1Q9Z160 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cog1Q9Z160 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cog1Q9Z160 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cog1Q9Z160 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cog1Q9Z160 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cog1Q9Z160 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cog1Q9Z160 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cog1Q9Z160 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cog1Q9Z160 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cog1Q9Z160 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cog1Q9Z160 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cog1Q9Z160 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cog1Q9Z160 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Cog1Q9Z160 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cog1Q9Z160 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Cog1Q9Z160 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cog1Q9Z160 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms