Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z104

Hmg20b, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20bQ9Z104 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
Hmg20bQ9Z104 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Hmg20bQ9Z104 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Hmg20bQ9Z104 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Hmg20bQ9Z104 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Hmg20bQ9Z104 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Hmg20bQ9Z104 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Hmg20bQ9Z104 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Hmg20bQ9Z104 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Hmg20bQ9Z104 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Hmg20bQ9Z104 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Hmg20bQ9Z104 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Hmg20bQ9Z104 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Hmg20bQ9Z104 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
Hmg20bQ9Z104 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Hmg20bQ9Z104 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Hmg20bQ9Z104 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
Hmg20bQ9Z104 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Hmg20bQ9Z104 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Hmg20bQ9Z104 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Hmg20bQ9Z104 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Hmg20bQ9Z104 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Hmg20bQ9Z104 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Hmg20bQ9Z104 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Hmg20bQ9Z104 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
Hmg20bQ9Z104 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Hmg20bQ9Z104 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Hmg20bQ9Z104 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Hmg20bQ9Z104 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Hmg20bQ9Z104 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
Hmg20bQ9Z104 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Hmg20bQ9Z104 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
Hmg20bQ9Z104 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Hmg20bQ9Z104 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Hmg20bQ9Z104 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Hmg20bQ9Z104 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Hmg20bQ9Z104 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Hmg20bQ9Z104 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
Hmg20bQ9Z104 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Hmg20bQ9Z104 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Hmg20bQ9Z104 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Hmg20bQ9Z104 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Hmg20bQ9Z104 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Hmg20bQ9Z104 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Hmg20bQ9Z104 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Hmg20bQ9Z104 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Hmg20bQ9Z104 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Hmg20bQ9Z104 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Hmg20bQ9Z104 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Hmg20bQ9Z104 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Hmg20bQ9Z104 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Hmg20bQ9Z104 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
Hmg20bQ9Z104 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Hmg20bQ9Z104 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Hmg20bQ9Z104 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Hmg20bQ9Z104 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Hmg20bQ9Z104 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Hmg20bQ9Z104 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Hmg20bQ9Z104 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Hmg20bQ9Z104 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
Hmg20bQ9Z104 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Hmg20bQ9Z104 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Hmg20bQ9Z104 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Hmg20bQ9Z104 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
Hmg20bQ9Z104 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Hmg20bQ9Z104 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Hmg20bQ9Z104 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Hmg20bQ9Z104 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Hmg20bQ9Z104 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Hmg20bQ9Z104 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Hmg20bQ9Z104 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Hmg20bQ9Z104 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Hmg20bQ9Z104 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Hmg20bQ9Z104 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Hmg20bQ9Z104 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Hmg20bQ9Z104 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Hmg20bQ9Z104 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Hmg20bQ9Z104 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Hmg20bQ9Z104 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Hmg20bQ9Z104 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Hmg20bQ9Z104 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Hmg20bQ9Z104 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Hmg20bQ9Z104 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Hmg20bQ9Z104 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Hmg20bQ9Z104 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Hmg20bQ9Z104 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Hmg20bQ9Z104 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Hmg20bQ9Z104 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Hmg20bQ9Z104 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Hmg20bQ9Z104 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Hmg20bQ9Z104 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Hmg20bQ9Z104 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Hmg20bQ9Z104 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Hmg20bQ9Z104 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Hmg20bQ9Z104 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Hmg20bQ9Z104 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Hmg20bQ9Z104 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Hmg20bQ9Z104 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Hmg20bQ9Z104 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Hmg20bQ9Z104 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.9 ms