Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0M6

Cd97, CD97 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd97Q9Z0M6 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cd97Q9Z0M6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cd97Q9Z0M6 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cd97Q9Z0M6 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cd97Q9Z0M6 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cd97Q9Z0M6 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cd97Q9Z0M6 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cd97Q9Z0M6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cd97Q9Z0M6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cd97Q9Z0M6 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Cd97Q9Z0M6 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cd97Q9Z0M6 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cd97Q9Z0M6 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cd97Q9Z0M6 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cd97Q9Z0M6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cd97Q9Z0M6 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cd97Q9Z0M6 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cd97Q9Z0M6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cd97Q9Z0M6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cd97Q9Z0M6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cd97Q9Z0M6 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cd97Q9Z0M6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cd97Q9Z0M6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cd97Q9Z0M6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cd97Q9Z0M6 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cd97Q9Z0M6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cd97Q9Z0M6 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cd97Q9Z0M6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cd97Q9Z0M6 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cd97Q9Z0M6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cd97Q9Z0M6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Cd97Q9Z0M6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cd97Q9Z0M6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cd97Q9Z0M6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cd97Q9Z0M6 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cd97Q9Z0M6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Cd97Q9Z0M6 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cd97Q9Z0M6 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cd97Q9Z0M6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cd97Q9Z0M6 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cd97Q9Z0M6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cd97Q9Z0M6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cd97Q9Z0M6 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cd97Q9Z0M6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cd97Q9Z0M6 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cd97Q9Z0M6 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cd97Q9Z0M6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Cd97Q9Z0M6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Cd97Q9Z0M6 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Cd97Q9Z0M6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cd97Q9Z0M6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cd97Q9Z0M6 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cd97Q9Z0M6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cd97Q9Z0M6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cd97Q9Z0M6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Cd97Q9Z0M6 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cd97Q9Z0M6 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cd97Q9Z0M6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cd97Q9Z0M6 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cd97Q9Z0M6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cd97Q9Z0M6 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cd97Q9Z0M6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cd97Q9Z0M6 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cd97Q9Z0M6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cd97Q9Z0M6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cd97Q9Z0M6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cd97Q9Z0M6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cd97Q9Z0M6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cd97Q9Z0M6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cd97Q9Z0M6 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cd97Q9Z0M6 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cd97Q9Z0M6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cd97Q9Z0M6 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cd97Q9Z0M6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cd97Q9Z0M6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cd97Q9Z0M6 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cd97Q9Z0M6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cd97Q9Z0M6 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cd97Q9Z0M6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cd97Q9Z0M6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cd97Q9Z0M6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cd97Q9Z0M6 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cd97Q9Z0M6 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cd97Q9Z0M6 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Cd97Q9Z0M6 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cd97Q9Z0M6 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cd97Q9Z0M6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cd97Q9Z0M6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cd97Q9Z0M6 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Cd97Q9Z0M6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cd97Q9Z0M6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cd97Q9Z0M6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cd97Q9Z0M6 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cd97Q9Z0M6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cd97Q9Z0M6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cd97Q9Z0M6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cd97Q9Z0M6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cd97Q9Z0M6 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cd97Q9Z0M6 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cd97Q9Z0M6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms