Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVL1

Ap4s1, AP-4 complex subunit sigma-1, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap4s1Q9WVL1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Ap4s1Q9WVL1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ap4s1Q9WVL1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ap4s1Q9WVL1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ap4s1Q9WVL1 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ap4s1Q9WVL1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ap4s1Q9WVL1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ap4s1Q9WVL1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ap4s1Q9WVL1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ap4s1Q9WVL1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ap4s1Q9WVL1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ap4s1Q9WVL1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ap4s1Q9WVL1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ap4s1Q9WVL1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ap4s1Q9WVL1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ap4s1Q9WVL1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ap4s1Q9WVL1 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ap4s1Q9WVL1 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ap4s1Q9WVL1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ap4s1Q9WVL1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ap4s1Q9WVL1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ap4s1Q9WVL1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ap4s1Q9WVL1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ap4s1Q9WVL1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ap4s1Q9WVL1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ap4s1Q9WVL1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ap4s1Q9WVL1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ap4s1Q9WVL1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ap4s1Q9WVL1 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ap4s1Q9WVL1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ap4s1Q9WVL1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ap4s1Q9WVL1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ap4s1Q9WVL1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ap4s1Q9WVL1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ap4s1Q9WVL1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ap4s1Q9WVL1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ap4s1Q9WVL1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ap4s1Q9WVL1 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ap4s1Q9WVL1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ap4s1Q9WVL1 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ap4s1Q9WVL1 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ap4s1Q9WVL1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ap4s1Q9WVL1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ap4s1Q9WVL1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ap4s1Q9WVL1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ap4s1Q9WVL1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ap4s1Q9WVL1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ap4s1Q9WVL1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ap4s1Q9WVL1 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ap4s1Q9WVL1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ap4s1Q9WVL1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ap4s1Q9WVL1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ap4s1Q9WVL1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ap4s1Q9WVL1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ap4s1Q9WVL1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ap4s1Q9WVL1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ap4s1Q9WVL1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ap4s1Q9WVL1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ap4s1Q9WVL1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ap4s1Q9WVL1 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ap4s1Q9WVL1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ap4s1Q9WVL1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ap4s1Q9WVL1 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ap4s1Q9WVL1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ap4s1Q9WVL1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ap4s1Q9WVL1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ap4s1Q9WVL1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ap4s1Q9WVL1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ap4s1Q9WVL1 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ap4s1Q9WVL1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ap4s1Q9WVL1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ap4s1Q9WVL1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ap4s1Q9WVL1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Ap4s1Q9WVL1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ap4s1Q9WVL1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ap4s1Q9WVL1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ap4s1Q9WVL1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ap4s1Q9WVL1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ap4s1Q9WVL1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ap4s1Q9WVL1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ap4s1Q9WVL1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ap4s1Q9WVL1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ap4s1Q9WVL1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ap4s1Q9WVL1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ap4s1Q9WVL1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ap4s1Q9WVL1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ap4s1Q9WVL1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ap4s1Q9WVL1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ap4s1Q9WVL1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ap4s1Q9WVL1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ap4s1Q9WVL1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ap4s1Q9WVL1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ap4s1Q9WVL1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ap4s1Q9WVL1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ap4s1Q9WVL1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ap4s1Q9WVL1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ap4s1Q9WVL1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ap4s1Q9WVL1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ap4s1Q9WVL1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ap4s1Q9WVL1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms