Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVD4

Clcn5, H(+)/Cl(-) exchange transporter 5, mousemouse

Predictions only

Length 746 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn5Q9WVD4 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Clcn5Q9WVD4 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Clcn5Q9WVD4 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Clcn5Q9WVD4 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Clcn5Q9WVD4 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Clcn5Q9WVD4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Clcn5Q9WVD4 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Clcn5Q9WVD4 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Clcn5Q9WVD4 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Clcn5Q9WVD4 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Clcn5Q9WVD4 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Clcn5Q9WVD4 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Clcn5Q9WVD4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Clcn5Q9WVD4 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Clcn5Q9WVD4 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Clcn5Q9WVD4 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Clcn5Q9WVD4 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Clcn5Q9WVD4 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Clcn5Q9WVD4 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Clcn5Q9WVD4 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Clcn5Q9WVD4 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Clcn5Q9WVD4 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Clcn5Q9WVD4 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Clcn5Q9WVD4 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Clcn5Q9WVD4 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Clcn5Q9WVD4 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Clcn5Q9WVD4 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Clcn5Q9WVD4 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Clcn5Q9WVD4 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Clcn5Q9WVD4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Clcn5Q9WVD4 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Clcn5Q9WVD4 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Clcn5Q9WVD4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Clcn5Q9WVD4 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Clcn5Q9WVD4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Clcn5Q9WVD4 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Clcn5Q9WVD4 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Clcn5Q9WVD4 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Clcn5Q9WVD4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Clcn5Q9WVD4 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Clcn5Q9WVD4 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Clcn5Q9WVD4 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Clcn5Q9WVD4 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Clcn5Q9WVD4 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Clcn5Q9WVD4 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Clcn5Q9WVD4 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Clcn5Q9WVD4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Clcn5Q9WVD4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Clcn5Q9WVD4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Clcn5Q9WVD4 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Clcn5Q9WVD4 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Clcn5Q9WVD4 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Clcn5Q9WVD4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Clcn5Q9WVD4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Clcn5Q9WVD4 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Clcn5Q9WVD4 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Clcn5Q9WVD4 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Clcn5Q9WVD4 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Clcn5Q9WVD4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Clcn5Q9WVD4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Clcn5Q9WVD4 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Clcn5Q9WVD4 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Clcn5Q9WVD4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Clcn5Q9WVD4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Clcn5Q9WVD4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Clcn5Q9WVD4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Clcn5Q9WVD4 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Clcn5Q9WVD4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Clcn5Q9WVD4 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Clcn5Q9WVD4 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Clcn5Q9WVD4 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Clcn5Q9WVD4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Clcn5Q9WVD4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Clcn5Q9WVD4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Clcn5Q9WVD4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Clcn5Q9WVD4 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Clcn5Q9WVD4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Clcn5Q9WVD4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Clcn5Q9WVD4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Clcn5Q9WVD4 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Clcn5Q9WVD4 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Clcn5Q9WVD4 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Clcn5Q9WVD4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Clcn5Q9WVD4 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Clcn5Q9WVD4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Clcn5Q9WVD4 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Clcn5Q9WVD4 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Clcn5Q9WVD4 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Clcn5Q9WVD4 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Clcn5Q9WVD4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Clcn5Q9WVD4 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Clcn5Q9WVD4 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Clcn5Q9WVD4 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Clcn5Q9WVD4 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Clcn5Q9WVD4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Clcn5Q9WVD4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Clcn5Q9WVD4 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Clcn5Q9WVD4 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Clcn5Q9WVD4 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Clcn5Q9WVD4 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms