Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV27

Atp1a4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1a4Q9WV27 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Atp1a4Q9WV27 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Atp1a4Q9WV27 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Atp1a4Q9WV27 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Atp1a4Q9WV27 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Atp1a4Q9WV27 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Atp1a4Q9WV27 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Atp1a4Q9WV27 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Atp1a4Q9WV27 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Atp1a4Q9WV27 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Atp1a4Q9WV27 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Atp1a4Q9WV27 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Atp1a4Q9WV27 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Atp1a4Q9WV27 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Atp1a4Q9WV27 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Atp1a4Q9WV27 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Atp1a4Q9WV27 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Atp1a4Q9WV27 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Atp1a4Q9WV27 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Atp1a4Q9WV27 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Atp1a4Q9WV27 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Atp1a4Q9WV27 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC28.51■■■□□ 2.16
Atp1a4Q9WV27 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Atp1a4Q9WV27 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Atp1a4Q9WV27 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Atp1a4Q9WV27 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Atp1a4Q9WV27 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Atp1a4Q9WV27 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Atp1a4Q9WV27 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Atp1a4Q9WV27 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Atp1a4Q9WV27 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Atp1a4Q9WV27 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Atp1a4Q9WV27 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Atp1a4Q9WV27 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Atp1a4Q9WV27 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Atp1a4Q9WV27 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Atp1a4Q9WV27 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Atp1a4Q9WV27 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Atp1a4Q9WV27 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Atp1a4Q9WV27 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Atp1a4Q9WV27 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Atp1a4Q9WV27 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Atp1a4Q9WV27 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Atp1a4Q9WV27 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Atp1a4Q9WV27 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Atp1a4Q9WV27 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Atp1a4Q9WV27 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Atp1a4Q9WV27 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Atp1a4Q9WV27 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Atp1a4Q9WV27 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Atp1a4Q9WV27 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Atp1a4Q9WV27 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Atp1a4Q9WV27 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Atp1a4Q9WV27 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Atp1a4Q9WV27 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Atp1a4Q9WV27 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Atp1a4Q9WV27 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Atp1a4Q9WV27 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Atp1a4Q9WV27 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Atp1a4Q9WV27 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Atp1a4Q9WV27 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Atp1a4Q9WV27 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Atp1a4Q9WV27 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Atp1a4Q9WV27 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Atp1a4Q9WV27 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Atp1a4Q9WV27 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Atp1a4Q9WV27 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Atp1a4Q9WV27 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Atp1a4Q9WV27 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Atp1a4Q9WV27 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Atp1a4Q9WV27 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Atp1a4Q9WV27 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Atp1a4Q9WV27 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Atp1a4Q9WV27 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Atp1a4Q9WV27 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Atp1a4Q9WV27 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Atp1a4Q9WV27 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Atp1a4Q9WV27 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Atp1a4Q9WV27 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Atp1a4Q9WV27 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Atp1a4Q9WV27 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Atp1a4Q9WV27 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Atp1a4Q9WV27 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Atp1a4Q9WV27 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Atp1a4Q9WV27 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Atp1a4Q9WV27 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Atp1a4Q9WV27 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Atp1a4Q9WV27 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Atp1a4Q9WV27 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Atp1a4Q9WV27 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.01■■■□□ 2.08
Atp1a4Q9WV27 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Atp1a4Q9WV27 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Atp1a4Q9WV27 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Atp1a4Q9WV27 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Atp1a4Q9WV27 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Atp1a4Q9WV27 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Atp1a4Q9WV27 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Atp1a4Q9WV27 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Atp1a4Q9WV27 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Atp1a4Q9WV27 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms