Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV27

Atp1a4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1a4Q9WV27 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,69■■■□□ 2,18
Atp1a4Q9WV27 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28,67■■■□□ 2,18
Atp1a4Q9WV27 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,67■■■□□ 2,18
Atp1a4Q9WV27 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC28,65■■■□□ 2,18
Atp1a4Q9WV27 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC28,65■■■□□ 2,18
Atp1a4Q9WV27 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,65■■■□□ 2,18
Atp1a4Q9WV27 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,65■■■□□ 2,18
Atp1a4Q9WV27 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC28,64■■■□□ 2,18
Atp1a4Q9WV27 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,64■■■□□ 2,18
Atp1a4Q9WV27 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28,63■■■□□ 2,17
Atp1a4Q9WV27 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,63■■■□□ 2,17
Atp1a4Q9WV27 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC28,63■■■□□ 2,17
Atp1a4Q9WV27 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,6■■■□□ 2,17
Atp1a4Q9WV27 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC28,57■■■□□ 2,16
Atp1a4Q9WV27 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28,57■■■□□ 2,16
Atp1a4Q9WV27 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,56■■■□□ 2,16
Atp1a4Q9WV27 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,54■■■□□ 2,16
Atp1a4Q9WV27 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,54■■■□□ 2,16
Atp1a4Q9WV27 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28,53■■■□□ 2,16
Atp1a4Q9WV27 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,53■■■□□ 2,16
Atp1a4Q9WV27 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,52■■■□□ 2,16
Atp1a4Q9WV27 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC28,51■■■□□ 2,16
Atp1a4Q9WV27 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,5■■■□□ 2,15
Atp1a4Q9WV27 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28,5■■■□□ 2,15
Atp1a4Q9WV27 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,49■■■□□ 2,15
Atp1a4Q9WV27 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC28,49■■■□□ 2,15
Atp1a4Q9WV27 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28,48■■■□□ 2,15
Atp1a4Q9WV27 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28,45■■■□□ 2,15
Atp1a4Q9WV27 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,43■■■□□ 2,14
Atp1a4Q9WV27 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,42■■■□□ 2,14
Atp1a4Q9WV27 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,42■■■□□ 2,14
Atp1a4Q9WV27 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC28,41■■■□□ 2,14
Atp1a4Q9WV27 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC28,39■■■□□ 2,14
Atp1a4Q9WV27 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC28,38■■■□□ 2,13
Atp1a4Q9WV27 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28,37■■■□□ 2,13
Atp1a4Q9WV27 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC28,37■■■□□ 2,13
Atp1a4Q9WV27 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC28,37■■■□□ 2,13
Atp1a4Q9WV27 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,36■■■□□ 2,13
Atp1a4Q9WV27 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28,35■■■□□ 2,13
Atp1a4Q9WV27 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,13
Atp1a4Q9WV27 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,13
Atp1a4Q9WV27 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,13
Atp1a4Q9WV27 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,13
Atp1a4Q9WV27 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28,32■■■□□ 2,12
Atp1a4Q9WV27 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,31■■■□□ 2,12
Atp1a4Q9WV27 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,31■■■□□ 2,12
Atp1a4Q9WV27 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,29■■■□□ 2,12
Atp1a4Q9WV27 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,29■■■□□ 2,12
Atp1a4Q9WV27 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC28,28■■■□□ 2,12
Atp1a4Q9WV27 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,28■■■□□ 2,12
Atp1a4Q9WV27 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28,27■■■□□ 2,12
Atp1a4Q9WV27 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,27■■■□□ 2,12
Atp1a4Q9WV27 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28,22■■■□□ 2,11
Atp1a4Q9WV27 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC28,22■■■□□ 2,11
Atp1a4Q9WV27 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28,21■■■□□ 2,11
Atp1a4Q9WV27 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,21■■■□□ 2,11
Atp1a4Q9WV27 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC28,2■■■□□ 2,1
Atp1a4Q9WV27 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,2■■■□□ 2,1
Atp1a4Q9WV27 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28,19■■■□□ 2,1
Atp1a4Q9WV27 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,19■■■□□ 2,1
Atp1a4Q9WV27 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,18■■■□□ 2,1
Atp1a4Q9WV27 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28,18■■■□□ 2,1
Atp1a4Q9WV27 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC28,17■■■□□ 2,1
Atp1a4Q9WV27 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,16■■■□□ 2,1
Atp1a4Q9WV27 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC28,16■■■□□ 2,1
Atp1a4Q9WV27 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,15■■■□□ 2,1
Atp1a4Q9WV27 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,15■■■□□ 2,1
Atp1a4Q9WV27 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28,15■■■□□ 2,1
Atp1a4Q9WV27 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,14■■■□□ 2,1
Atp1a4Q9WV27 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,14■■■□□ 2,1
Atp1a4Q9WV27 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,13■■■□□ 2,09
Atp1a4Q9WV27 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28,12■■■□□ 2,09
Atp1a4Q9WV27 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,12■■■□□ 2,09
Atp1a4Q9WV27 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,11■■■□□ 2,09
Atp1a4Q9WV27 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28,1■■■□□ 2,09
Atp1a4Q9WV27 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,09■■■□□ 2,09
Atp1a4Q9WV27 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,09■■■□□ 2,09
Atp1a4Q9WV27 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,08■■■□□ 2,09
Atp1a4Q9WV27 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,07■■■□□ 2,08
Atp1a4Q9WV27 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28,06■■■□□ 2,08
Atp1a4Q9WV27 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,06■■■□□ 2,08
Atp1a4Q9WV27 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,06■■■□□ 2,08
Atp1a4Q9WV27 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,05■■■□□ 2,08
Atp1a4Q9WV27 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC28,05■■■□□ 2,08
Atp1a4Q9WV27 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,04■■■□□ 2,08
Atp1a4Q9WV27 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28,04■■■□□ 2,08
Atp1a4Q9WV27 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28,04■■■□□ 2,08
Atp1a4Q9WV27 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,02■■■□□ 2,08
Atp1a4Q9WV27 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,02■■■□□ 2,08
Atp1a4Q9WV27 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28,01■■■□□ 2,08
Atp1a4Q9WV27 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2,07
Atp1a4Q9WV27 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2,07
Atp1a4Q9WV27 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,98■■■□□ 2,07
Atp1a4Q9WV27 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,98■■■□□ 2,07
Atp1a4Q9WV27 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,96■■■□□ 2,07
Atp1a4Q9WV27 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,96■■■□□ 2,07
Atp1a4Q9WV27 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,95■■■□□ 2,07
Atp1a4Q9WV27 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,95■■■□□ 2,06
Atp1a4Q9WV27 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,95■■■□□ 2,06
Atp1a4Q9WV27 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,94■■■□□ 2,06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,2 ms