Protein–RNA interactions for Protein: Q9R207

Nbn, Nibrin, mousemouse

Predictions only

Length 751 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NbnQ9R207 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NbnQ9R207 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
NbnQ9R207 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NbnQ9R207 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NbnQ9R207 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NbnQ9R207 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NbnQ9R207 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NbnQ9R207 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NbnQ9R207 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NbnQ9R207 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NbnQ9R207 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NbnQ9R207 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NbnQ9R207 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NbnQ9R207 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NbnQ9R207 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
NbnQ9R207 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NbnQ9R207 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NbnQ9R207 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NbnQ9R207 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NbnQ9R207 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NbnQ9R207 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NbnQ9R207 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NbnQ9R207 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NbnQ9R207 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NbnQ9R207 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NbnQ9R207 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
NbnQ9R207 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NbnQ9R207 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NbnQ9R207 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NbnQ9R207 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NbnQ9R207 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NbnQ9R207 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NbnQ9R207 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NbnQ9R207 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NbnQ9R207 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NbnQ9R207 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NbnQ9R207 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
NbnQ9R207 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
NbnQ9R207 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
NbnQ9R207 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NbnQ9R207 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NbnQ9R207 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
NbnQ9R207 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NbnQ9R207 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NbnQ9R207 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NbnQ9R207 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NbnQ9R207 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NbnQ9R207 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NbnQ9R207 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NbnQ9R207 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NbnQ9R207 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NbnQ9R207 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NbnQ9R207 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NbnQ9R207 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NbnQ9R207 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NbnQ9R207 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NbnQ9R207 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NbnQ9R207 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NbnQ9R207 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NbnQ9R207 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NbnQ9R207 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NbnQ9R207 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NbnQ9R207 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NbnQ9R207 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NbnQ9R207 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NbnQ9R207 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NbnQ9R207 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NbnQ9R207 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
NbnQ9R207 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NbnQ9R207 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NbnQ9R207 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NbnQ9R207 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NbnQ9R207 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NbnQ9R207 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NbnQ9R207 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NbnQ9R207 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NbnQ9R207 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NbnQ9R207 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NbnQ9R207 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NbnQ9R207 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NbnQ9R207 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NbnQ9R207 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
NbnQ9R207 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NbnQ9R207 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NbnQ9R207 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NbnQ9R207 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NbnQ9R207 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NbnQ9R207 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NbnQ9R207 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NbnQ9R207 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
NbnQ9R207 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NbnQ9R207 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NbnQ9R207 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NbnQ9R207 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NbnQ9R207 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NbnQ9R207 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
NbnQ9R207 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NbnQ9R207 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NbnQ9R207 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NbnQ9R207 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms