Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1T4

Sept6, Septin-6, mousemouse

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept6Q9R1T4 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sept6Q9R1T4 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sept6Q9R1T4 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sept6Q9R1T4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sept6Q9R1T4 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sept6Q9R1T4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sept6Q9R1T4 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sept6Q9R1T4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sept6Q9R1T4 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sept6Q9R1T4 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Sept6Q9R1T4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sept6Q9R1T4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Sept6Q9R1T4 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sept6Q9R1T4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sept6Q9R1T4 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sept6Q9R1T4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sept6Q9R1T4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sept6Q9R1T4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sept6Q9R1T4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sept6Q9R1T4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sept6Q9R1T4 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sept6Q9R1T4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Sept6Q9R1T4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sept6Q9R1T4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sept6Q9R1T4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sept6Q9R1T4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sept6Q9R1T4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sept6Q9R1T4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sept6Q9R1T4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sept6Q9R1T4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sept6Q9R1T4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sept6Q9R1T4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sept6Q9R1T4 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sept6Q9R1T4 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sept6Q9R1T4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sept6Q9R1T4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sept6Q9R1T4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sept6Q9R1T4 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sept6Q9R1T4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Sept6Q9R1T4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sept6Q9R1T4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sept6Q9R1T4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sept6Q9R1T4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sept6Q9R1T4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sept6Q9R1T4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sept6Q9R1T4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sept6Q9R1T4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sept6Q9R1T4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sept6Q9R1T4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sept6Q9R1T4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sept6Q9R1T4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Sept6Q9R1T4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Sept6Q9R1T4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sept6Q9R1T4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sept6Q9R1T4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sept6Q9R1T4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sept6Q9R1T4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sept6Q9R1T4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Sept6Q9R1T4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sept6Q9R1T4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sept6Q9R1T4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sept6Q9R1T4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sept6Q9R1T4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sept6Q9R1T4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Sept6Q9R1T4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sept6Q9R1T4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sept6Q9R1T4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sept6Q9R1T4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sept6Q9R1T4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sept6Q9R1T4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sept6Q9R1T4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sept6Q9R1T4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sept6Q9R1T4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Sept6Q9R1T4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sept6Q9R1T4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sept6Q9R1T4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sept6Q9R1T4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Sept6Q9R1T4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sept6Q9R1T4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sept6Q9R1T4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sept6Q9R1T4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sept6Q9R1T4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sept6Q9R1T4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sept6Q9R1T4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Sept6Q9R1T4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sept6Q9R1T4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sept6Q9R1T4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sept6Q9R1T4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sept6Q9R1T4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sept6Q9R1T4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sept6Q9R1T4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sept6Q9R1T4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sept6Q9R1T4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sept6Q9R1T4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sept6Q9R1T4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sept6Q9R1T4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sept6Q9R1T4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sept6Q9R1T4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sept6Q9R1T4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sept6Q9R1T4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms