Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A3

Ntn3, Netrin-3, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntn3Q9R1A3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ntn3Q9R1A3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ntn3Q9R1A3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ntn3Q9R1A3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ntn3Q9R1A3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ntn3Q9R1A3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ntn3Q9R1A3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ntn3Q9R1A3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ntn3Q9R1A3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ntn3Q9R1A3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ntn3Q9R1A3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ntn3Q9R1A3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ntn3Q9R1A3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ntn3Q9R1A3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ntn3Q9R1A3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ntn3Q9R1A3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ntn3Q9R1A3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ntn3Q9R1A3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ntn3Q9R1A3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ntn3Q9R1A3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ntn3Q9R1A3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ntn3Q9R1A3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ntn3Q9R1A3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ntn3Q9R1A3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ntn3Q9R1A3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ntn3Q9R1A3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ntn3Q9R1A3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ntn3Q9R1A3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ntn3Q9R1A3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ntn3Q9R1A3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Ntn3Q9R1A3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Ntn3Q9R1A3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ntn3Q9R1A3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ntn3Q9R1A3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Ntn3Q9R1A3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ntn3Q9R1A3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ntn3Q9R1A3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ntn3Q9R1A3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ntn3Q9R1A3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ntn3Q9R1A3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ntn3Q9R1A3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ntn3Q9R1A3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ntn3Q9R1A3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ntn3Q9R1A3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ntn3Q9R1A3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ntn3Q9R1A3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ntn3Q9R1A3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ntn3Q9R1A3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ntn3Q9R1A3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ntn3Q9R1A3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ntn3Q9R1A3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ntn3Q9R1A3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ntn3Q9R1A3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ntn3Q9R1A3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ntn3Q9R1A3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Ntn3Q9R1A3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ntn3Q9R1A3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ntn3Q9R1A3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ntn3Q9R1A3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ntn3Q9R1A3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ntn3Q9R1A3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ntn3Q9R1A3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ntn3Q9R1A3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ntn3Q9R1A3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ntn3Q9R1A3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ntn3Q9R1A3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ntn3Q9R1A3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ntn3Q9R1A3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ntn3Q9R1A3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ntn3Q9R1A3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ntn3Q9R1A3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ntn3Q9R1A3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ntn3Q9R1A3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ntn3Q9R1A3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ntn3Q9R1A3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ntn3Q9R1A3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ntn3Q9R1A3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ntn3Q9R1A3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ntn3Q9R1A3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ntn3Q9R1A3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ntn3Q9R1A3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ntn3Q9R1A3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ntn3Q9R1A3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ntn3Q9R1A3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ntn3Q9R1A3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ntn3Q9R1A3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ntn3Q9R1A3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ntn3Q9R1A3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ntn3Q9R1A3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Ntn3Q9R1A3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ntn3Q9R1A3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ntn3Q9R1A3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ntn3Q9R1A3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ntn3Q9R1A3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ntn3Q9R1A3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ntn3Q9R1A3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ntn3Q9R1A3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ntn3Q9R1A3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ntn3Q9R1A3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ntn3Q9R1A3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms