Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0L1

Hsf4, Heat shock factor protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hsf4Q9R0L1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hsf4Q9R0L1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hsf4Q9R0L1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hsf4Q9R0L1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hsf4Q9R0L1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hsf4Q9R0L1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hsf4Q9R0L1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hsf4Q9R0L1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hsf4Q9R0L1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hsf4Q9R0L1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hsf4Q9R0L1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hsf4Q9R0L1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Hsf4Q9R0L1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Hsf4Q9R0L1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Hsf4Q9R0L1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hsf4Q9R0L1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hsf4Q9R0L1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hsf4Q9R0L1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hsf4Q9R0L1 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hsf4Q9R0L1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hsf4Q9R0L1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Hsf4Q9R0L1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hsf4Q9R0L1 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hsf4Q9R0L1 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Hsf4Q9R0L1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hsf4Q9R0L1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hsf4Q9R0L1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Hsf4Q9R0L1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hsf4Q9R0L1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hsf4Q9R0L1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hsf4Q9R0L1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hsf4Q9R0L1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hsf4Q9R0L1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hsf4Q9R0L1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hsf4Q9R0L1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hsf4Q9R0L1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hsf4Q9R0L1 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hsf4Q9R0L1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hsf4Q9R0L1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hsf4Q9R0L1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hsf4Q9R0L1 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Hsf4Q9R0L1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hsf4Q9R0L1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hsf4Q9R0L1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hsf4Q9R0L1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hsf4Q9R0L1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Hsf4Q9R0L1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hsf4Q9R0L1 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hsf4Q9R0L1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hsf4Q9R0L1 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hsf4Q9R0L1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hsf4Q9R0L1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hsf4Q9R0L1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hsf4Q9R0L1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hsf4Q9R0L1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hsf4Q9R0L1 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hsf4Q9R0L1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Hsf4Q9R0L1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hsf4Q9R0L1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hsf4Q9R0L1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hsf4Q9R0L1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hsf4Q9R0L1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hsf4Q9R0L1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hsf4Q9R0L1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hsf4Q9R0L1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hsf4Q9R0L1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hsf4Q9R0L1 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hsf4Q9R0L1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hsf4Q9R0L1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hsf4Q9R0L1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Hsf4Q9R0L1 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hsf4Q9R0L1 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hsf4Q9R0L1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hsf4Q9R0L1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hsf4Q9R0L1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hsf4Q9R0L1 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hsf4Q9R0L1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hsf4Q9R0L1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hsf4Q9R0L1 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hsf4Q9R0L1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hsf4Q9R0L1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hsf4Q9R0L1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hsf4Q9R0L1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hsf4Q9R0L1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hsf4Q9R0L1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hsf4Q9R0L1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hsf4Q9R0L1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hsf4Q9R0L1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Hsf4Q9R0L1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Hsf4Q9R0L1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Hsf4Q9R0L1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Hsf4Q9R0L1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hsf4Q9R0L1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hsf4Q9R0L1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hsf4Q9R0L1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hsf4Q9R0L1 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Hsf4Q9R0L1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hsf4Q9R0L1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hsf4Q9R0L1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hsf4Q9R0L1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms