Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E2

Plod1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod1Q9R0E2 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Plod1Q9R0E2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Plod1Q9R0E2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Plod1Q9R0E2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Plod1Q9R0E2 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
Plod1Q9R0E2 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Plod1Q9R0E2 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Plod1Q9R0E2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Plod1Q9R0E2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Plod1Q9R0E2 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Plod1Q9R0E2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Plod1Q9R0E2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Plod1Q9R0E2 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Plod1Q9R0E2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Plod1Q9R0E2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Plod1Q9R0E2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Plod1Q9R0E2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Plod1Q9R0E2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Plod1Q9R0E2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Plod1Q9R0E2 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Plod1Q9R0E2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Plod1Q9R0E2 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Plod1Q9R0E2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Plod1Q9R0E2 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Plod1Q9R0E2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Plod1Q9R0E2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Plod1Q9R0E2 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Plod1Q9R0E2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Plod1Q9R0E2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Plod1Q9R0E2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Plod1Q9R0E2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Plod1Q9R0E2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Plod1Q9R0E2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Plod1Q9R0E2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Plod1Q9R0E2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Plod1Q9R0E2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Plod1Q9R0E2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Plod1Q9R0E2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Plod1Q9R0E2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Plod1Q9R0E2 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Plod1Q9R0E2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Plod1Q9R0E2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Plod1Q9R0E2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Plod1Q9R0E2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Plod1Q9R0E2 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Plod1Q9R0E2 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Plod1Q9R0E2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Plod1Q9R0E2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Plod1Q9R0E2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Plod1Q9R0E2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Plod1Q9R0E2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Plod1Q9R0E2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Plod1Q9R0E2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Plod1Q9R0E2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Plod1Q9R0E2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Plod1Q9R0E2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Plod1Q9R0E2 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Plod1Q9R0E2 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Plod1Q9R0E2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Plod1Q9R0E2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Plod1Q9R0E2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Plod1Q9R0E2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Plod1Q9R0E2 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Plod1Q9R0E2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Plod1Q9R0E2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Plod1Q9R0E2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Plod1Q9R0E2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Plod1Q9R0E2 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Plod1Q9R0E2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Plod1Q9R0E2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Plod1Q9R0E2 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Plod1Q9R0E2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Plod1Q9R0E2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Plod1Q9R0E2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Plod1Q9R0E2 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Plod1Q9R0E2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Plod1Q9R0E2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Plod1Q9R0E2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Plod1Q9R0E2 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Plod1Q9R0E2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Plod1Q9R0E2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Plod1Q9R0E2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Plod1Q9R0E2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Plod1Q9R0E2 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Plod1Q9R0E2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Plod1Q9R0E2 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Plod1Q9R0E2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Plod1Q9R0E2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Plod1Q9R0E2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Plod1Q9R0E2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Plod1Q9R0E2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Plod1Q9R0E2 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Plod1Q9R0E2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Plod1Q9R0E2 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Plod1Q9R0E2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Plod1Q9R0E2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Plod1Q9R0E2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Plod1Q9R0E2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Plod1Q9R0E2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Plod1Q9R0E2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms