Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B7

Znf346, Zinc finger protein 346, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf346Q9R0B7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Znf346Q9R0B7 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Znf346Q9R0B7 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Znf346Q9R0B7 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Znf346Q9R0B7 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Znf346Q9R0B7 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Znf346Q9R0B7 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Znf346Q9R0B7 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Znf346Q9R0B7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Znf346Q9R0B7 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Znf346Q9R0B7 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Znf346Q9R0B7 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Znf346Q9R0B7 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Znf346Q9R0B7 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Znf346Q9R0B7 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Znf346Q9R0B7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Znf346Q9R0B7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Znf346Q9R0B7 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Znf346Q9R0B7 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Znf346Q9R0B7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Znf346Q9R0B7 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Znf346Q9R0B7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Znf346Q9R0B7 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Znf346Q9R0B7 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Znf346Q9R0B7 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Znf346Q9R0B7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Znf346Q9R0B7 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Znf346Q9R0B7 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Znf346Q9R0B7 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Znf346Q9R0B7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Znf346Q9R0B7 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Znf346Q9R0B7 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Znf346Q9R0B7 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Znf346Q9R0B7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Znf346Q9R0B7 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Znf346Q9R0B7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Znf346Q9R0B7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Znf346Q9R0B7 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Znf346Q9R0B7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Znf346Q9R0B7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Znf346Q9R0B7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Znf346Q9R0B7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Znf346Q9R0B7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Znf346Q9R0B7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Znf346Q9R0B7 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Znf346Q9R0B7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Znf346Q9R0B7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Znf346Q9R0B7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Znf346Q9R0B7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Znf346Q9R0B7 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Znf346Q9R0B7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Znf346Q9R0B7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Znf346Q9R0B7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Znf346Q9R0B7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Znf346Q9R0B7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Znf346Q9R0B7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Znf346Q9R0B7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Znf346Q9R0B7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Znf346Q9R0B7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Znf346Q9R0B7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Znf346Q9R0B7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Znf346Q9R0B7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Znf346Q9R0B7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Znf346Q9R0B7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Znf346Q9R0B7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Znf346Q9R0B7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Znf346Q9R0B7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Znf346Q9R0B7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Znf346Q9R0B7 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Znf346Q9R0B7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Znf346Q9R0B7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Znf346Q9R0B7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Znf346Q9R0B7 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Znf346Q9R0B7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Znf346Q9R0B7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Znf346Q9R0B7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Znf346Q9R0B7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Znf346Q9R0B7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Znf346Q9R0B7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Znf346Q9R0B7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Znf346Q9R0B7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Znf346Q9R0B7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Znf346Q9R0B7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Znf346Q9R0B7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Znf346Q9R0B7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Znf346Q9R0B7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Znf346Q9R0B7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Znf346Q9R0B7 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Znf346Q9R0B7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Znf346Q9R0B7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Znf346Q9R0B7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Znf346Q9R0B7 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Znf346Q9R0B7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Znf346Q9R0B7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Znf346Q9R0B7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Znf346Q9R0B7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Znf346Q9R0B7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Znf346Q9R0B7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Znf346Q9R0B7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Znf346Q9R0B7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.8 ms