Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Nek3Q9R0A5 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Nek3Q9R0A5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Nek3Q9R0A5 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Nek3Q9R0A5 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Nek3Q9R0A5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Nek3Q9R0A5 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Nek3Q9R0A5 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Nek3Q9R0A5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nek3Q9R0A5 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nek3Q9R0A5 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Nek3Q9R0A5 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Nek3Q9R0A5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Nek3Q9R0A5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Nek3Q9R0A5 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Nek3Q9R0A5 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Nek3Q9R0A5 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Nek3Q9R0A5 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Nek3Q9R0A5 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Nek3Q9R0A5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Nek3Q9R0A5 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Nek3Q9R0A5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Nek3Q9R0A5 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Nek3Q9R0A5 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Nek3Q9R0A5 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Nek3Q9R0A5 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Nek3Q9R0A5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Nek3Q9R0A5 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Nek3Q9R0A5 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Nek3Q9R0A5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Nek3Q9R0A5 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Nek3Q9R0A5 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Nek3Q9R0A5 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Nek3Q9R0A5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Nek3Q9R0A5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Nek3Q9R0A5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Nek3Q9R0A5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Nek3Q9R0A5 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Nek3Q9R0A5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Nek3Q9R0A5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Nek3Q9R0A5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Nek3Q9R0A5 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Nek3Q9R0A5 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Nek3Q9R0A5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Nek3Q9R0A5 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Nek3Q9R0A5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Nek3Q9R0A5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Nek3Q9R0A5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Nek3Q9R0A5 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Nek3Q9R0A5 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Nek3Q9R0A5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Nek3Q9R0A5 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Nek3Q9R0A5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Nek3Q9R0A5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Nek3Q9R0A5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Nek3Q9R0A5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Nek3Q9R0A5 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Nek3Q9R0A5 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Nek3Q9R0A5 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Nek3Q9R0A5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Nek3Q9R0A5 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nek3Q9R0A5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nek3Q9R0A5 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nek3Q9R0A5 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nek3Q9R0A5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Nek3Q9R0A5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Nek3Q9R0A5 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Nek3Q9R0A5 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nek3Q9R0A5 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Nek3Q9R0A5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Nek3Q9R0A5 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Nek3Q9R0A5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Nek3Q9R0A5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Nek3Q9R0A5 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Nek3Q9R0A5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Nek3Q9R0A5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Nek3Q9R0A5 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Nek3Q9R0A5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Nek3Q9R0A5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Nek3Q9R0A5 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Nek3Q9R0A5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Nek3Q9R0A5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Nek3Q9R0A5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Nek3Q9R0A5 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Nek3Q9R0A5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Nek3Q9R0A5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Nek3Q9R0A5 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Nek3Q9R0A5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Nek3Q9R0A5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Nek3Q9R0A5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Nek3Q9R0A5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Nek3Q9R0A5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Nek3Q9R0A5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Nek3Q9R0A5 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Nek3Q9R0A5 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Nek3Q9R0A5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Nek3Q9R0A5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Nek3Q9R0A5 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Nek3Q9R0A5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Nek3Q9R0A5 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms